| № | ﾚ | Crew | 1000m | 2000ｍ | Rank | Qualify |
| 23 6月27日 11:50 予選 １組 2上り |
1 | 滋賀大学経済学部A | 3:47.70 | 7:57.52 | 4 | |
| 2 | 富山国際大学 | 3:35.84 | 7:21.69 | 2 | →準決勝 | |
| 3 | 神戸大学 | 3:44.44 | 7:39.84 | 3 | ||
| 4 | 滋賀大学教育学部 | 3:51.02 | 8:02.40 | 5 | ||
| 5 | 岡山大学「六花」 | 3:31.79 | 7:13.02 | 1 | →準決勝 | |
| 6 |
| № | ﾚ | Crew | 1000m | 2000ｍ | Rank | Qualify |
| 24 6月27日 12:00 予選 ２組 2上り |
1 | 熊本大学 | 3:36.94 | 7:39.71 | 4 | |
| 2 | トヨタ自動車 | 3:37.58 | 7:26.71 | 1 | →準決勝 | |
| 3 | 山口選抜 | 3:36.30 | 7:28.36 | 2 | →準決勝 | |
| 4 | 九州大学 | 3:35.70 | 7:34.27 | 3 | ||
| 5 | 大阪工業大学C | 4:01.94 | 8:25.59 | 5 | ||
| 6 |
| № | ﾚ | Crew | 1000m | 2000ｍ | Rank | Qualify |
| 25 6月27日 12:10 予選 ３組 2上り |
1 | 関西学院大学Ａ | 3:53.26 | 8:09.45 | 4 | |
| 2 | 関西学院大学Ｂ | 3:46.52 | 8:24.84 | 5 | ||
| 3 | 関西大学 | 3:47.26 | 7:54.34 | 3 | ||
| 4 | 大阪府立大学 朱雀 | 3:44.35 | 7:46.05 | 2 | →準決勝 | |
| 5 | 龍谷大学 | 3:34.67 | 7:31.84 | 1 | →準決勝 | |
| 6 |
| № | ﾚ | Crew | 1000m | 2000ｍ | Rank | Qualify |
| 26 6月27日 12:20 予選 ４組 2上り |
1 | 鳥取大学 駿風 | 3:36.12 | 7:30.23 | 1 | →準決勝 |
| 2 | 鳥取大学 疾風 | 3:53.70 | 8:17.12 | 5 | ||
| 3 | 名古屋大学 | 3:41.44 | 7:36.55 | 2 | →準決勝 | |
| 4 | 大阪工業大学A | 3:48.39 | 7:51.69 | 3 | ||
| 5 | 大阪大学医学部 IXION | 3:54.61 | 8:10.95 | 4 | ||
| 6 |
| № | ﾚ | Crew | 1000m | 2000ｍ | Rank | Qualify |
| 27 6月27日 12:30 予選 ５組 2上り |
1 | 滋賀銀行・島根選抜 | 3:40.60 | 7:37.54 | 1 | →準決勝 |
| 2 | 滋賀大学経済学部B | 3:54.23 | 8:10.54 | 3 | ||
| 3 | 追手門学院大学 | 4:10.96 | 8:49.52 | 6 | ||
| 4 | 大阪大学医学部 TRISTAN | 3:51.51 | 8:01.55 | 2 | →準決勝 | |
| 5 | 大阪歯科大学 咬竜 | 4:09.09 | 8:42.80 | 5 | ||
| 6 | 大阪工業大学B | 3:59.80 | 8:23.25 | 4 |
| № | ﾚ | Crew | 1000m | 2000ｍ | Rank | Qualify |
| 47 6月27日 15:56 敗復 １組 2上り |
1 | 関西学院大学Ｂ | 4:02.43 | 8:01.22 | 3 | |
| 2 | 滋賀大学教育学部 | 4:10.43 | 8:25.78 | 4 | ||
| 3 | 九州大学 | 3:53.55 | 7:54.93 | 1 | →準決勝 | |
| 4 | 滋賀大学経済学部A | 3:57.15 | 7:59.98 | 2 | →準決勝 | |
| 5 | 大阪工業大学B | 4:14.74 | 8:40.89 | 5 | ||
| 6 |
| № | ﾚ | Crew | 1000m | 2000ｍ | Rank | Qualify |
| 48 6月27日 16:06 敗復 ２組 2上り |
1 | 大阪工業大学C | 4:03.70 | 8:25.35 | 5 | |
| 2 | 関西学院大学Ａ | 3:49.68 | 7:53.96 | 2 | →準決勝 | |
| 3 | 熊本大学 | 3:41.01 | 7:40.66 | 1 | →準決勝 | |
| 4 | 関西大学 | 3:52.33 | 7:57.93 | 3 | ||
| 5 | 鳥取大学 疾風 | 3:53.41 | 8:07.40 | 4 | ||
| 6 |
| № | ﾚ | Crew | 1000m | 2000ｍ | Rank | Qualify |
| 49 6月27日 16:16 敗復 ３組 2上り |
1 | 大阪歯科大学 咬竜 | 4:31.99 | 9:18.22 | 5 | |
| 2 | 滋賀大学経済学部B | 4:01.69 | 8:15.38 | 4 | ||
| 3 | 神戸大学 | 3:54.26 | 7:51.71 | 2 | →準決勝 | |
| 4 | 大阪工業大学A | 3:55.33 | 7:51.06 | 1 | →準決勝 | |
| 5 | 大阪大学医学部 IXION | 4:01.01 | 8:13.85 | 3 | ||
| 6 | 追手門学院大学 | 棄権 |
| № | ﾚ | Crew | 1000m | 2000ｍ | Rank | Qualify |
| 62 6月28日 10:06 準決 １組 2上り |
1 | 神戸大学 | 3:24.06 | 6:50.94 | 4 | |
| 2 | 名古屋大学 | 3:20.35 | 6:40.96 | 2 | →決勝 | |
| 3 | 岡山大学「六花」 | 3:17.48 | 6:38.66 | 1 | →決勝 | |
| 4 | 龍谷大学 | 3:18.08 | 6:41.36 | 3 | ||
| 5 | 大阪工業大学A | 3:31.79 | 7:06.70 | 5 | ||
| 6 |
| № | ﾚ | Crew | 1000m | 2000ｍ | Rank | Qualify |
| 63 6月28日 10:16 準決 ２組 2上り |
1 | 関西学院大学Ａ | 3:21.47 | 6:52.03 | 5 | |
| 2 | 滋賀銀行・島根選抜 | 3:14.88 | 6:40.25 | 3 | ||
| 3 | 富山国際大学 | 3:15.92 | 6:38.40 | 2 | →決勝 | |
| 4 | 鳥取大学 駿風 | 3:18.64 | 6:38.03 | 1 | →決勝 | |
| 5 | 熊本大学 | 3:18.30 | 6:42.95 | 4 | ||
| 6 |
| № | ﾚ | Crew | 1000m | 2000ｍ | Rank | Qualify |
| 64 6月28日 10:26 準決 ３組 2上り |
1 | 九州大学 | 3:22.12 | 6:52.97 | 3 | |
| 2 | 大阪府立大学 朱雀 | 3:29.12 | 7:00.79 | 4 | ||
| 3 | トヨタ自動車 | 3:16.11 | 6:41.87 | 1 | →決勝 | |
| 4 | 山口選抜 | 3:20.70 | 6:47.54 | 2 | →決勝 | |
| 5 | 大阪大学医学部 TRISTAN | 3:33.71 | 7:09.92 | 5 | ||
| 6 | 滋賀大学経済学部A | 3:22.21 | 7:15.99 | 6 |
| № | ﾚ | Crew | 1000m | 2000ｍ | Rank | Qualify |
| 72 6月28日 12:45 決勝 １組 |
1 | トヨタ自動車 | 3:11.41 | 6:27.18 | 1 | |
| 2 | 岡山大学「六花」 | 3:12.91 | 6:28.98 | 2 | ||
| 3 | 鳥取大学 駿風 | 3:16.72 | 6:33.51 | 4 | ||
| 4 | 富山国際大学 | 3:16.93 | 6:32.77 | 3 | ||
| 5 | 名古屋大学 | 3:23.19 | 6:44.59 | 5 | ||
| 6 | 山口選抜 | 3:22.08 | 6:45.88 | 6 |