| № | ﾚ | Crew | 500m | 1000m | Rank | Qualify |
| 32 5月1日 13:08 予選 １組 2上り |
1 | 愛媛大学附属A | 3:40.83 | 2 | →準決勝 | |
| 2 | 岡谷南高校B | 3:52.62 | 5 | |||
| 3 | 堀川高校A | DNS | ||||
| 4 | 松山東高校B | 3:51.76 | 4 | |||
| 5 | 今治工業高校A | 3:28.26 | 1 | →準決勝 | ||
| 6 | 八幡商業高校 | 3:49.34 | 3 |
| № | ﾚ | Crew | 500m | 1000m | Rank | Qualify |
| 33 5月1日 13:16 予選 ２組 2上り |
1 | |||||
| 2 | 関西高校A | 3:27.34 | 1 | →準決勝 | ||
| 3 | 海洋高校B | 3:29.16 | 2 | →準決勝 | ||
| 4 | 十津川高校A | 4:17.74 | 5 | |||
| 5 | 大津高校B | 3:41.23 | 4 | |||
| 6 | 東舞鶴高校A | 3:33.27 | 3 |
| № | ﾚ | Crew | 500m | 1000m | Rank | Qualify |
| 34 5月1日 13:24 予選 ３組 2上り |
1 | |||||
| 2 | 今治工業高校B | 3:35.95 | 1 | →準決勝 | ||
| 3 | 徳島市立高校 | 3:54.40 | 4 | |||
| 4 | 今治北高校C | 3:41.43 | 3 | |||
| 5 | 膳所高校C | 4:10.23 | 5 | |||
| 6 | 彦根東高校 A | 3:36.42 | 2 | →準決勝 |
| № | ﾚ | Crew | 500m | 1000m | Rank | Qualify |
| 35 5月1日 13:32 予選 ４組 2上り |
1 | |||||
| 2 | 京都工学院A | 3:29.11 | 1 | →準決勝 | ||
| 3 | 松山東高校A | 3:43.81 | 4 | |||
| 4 | 今治北高校B | 3:39.34 | 3 | |||
| 5 | 愛媛大学附属B | 5:13.54 | 5 | |||
| 6 | 瀬田工業高校 | 3:32.20 | 2 | →準決勝 |
| № | ﾚ | Crew | 500m | 1000m | Rank | Qualify |
| 36 5月1日 13:40 予選 ５組 2上り |
1 | |||||
| 2 | 桜宮高校 | 3:43.06 | 4 | |||
| 3 | 大津高校A | 3:31.64 | 1 | →準決勝 | ||
| 4 | 宮津天橋高校A | 3:53.41 | 5 | |||
| 5 | 岡谷南高校A | 3:42.04 | 3 | |||
| 6 | 海洋高校A | 3:37.80 | 2 | →準決勝 |
| № | ﾚ | Crew | 500m | 1000m | Rank | Qualify |
| 37 5月1日 13:48 予選 ６組 2上り |
1 | |||||
| 2 | 堀川高校B | 3:44.28 | 4 | |||
| 3 | 関西高校B | 3:34.85 | 3 | |||
| 4 | 今治北高校A | 3:27.13 | 1 | →準決勝 | ||
| 5 | 熊本学園大学付属高校 | 3:28.28 | 2 | →準決勝 | ||
| 6 | 洲本高校 | 4:02.39 | 5 |
| № | ﾚ | Crew | 500m | 1000m | Rank | Qualify |
| 38 5月1日 13:56 予選 ７組 2上り |
1 | |||||
| 2 | 彦根東高校 B | 3:35.90 | 3 | |||
| 3 | 高島高校 | 3:32.84 | 2 | →準決勝 | ||
| 4 | 膳所高校B | 3:46.52 | 4 | |||
| 5 | 松江高専 | 3:31.41 | 1 | →準決勝 | ||
| 6 | 宮津天橋高校B | 4:18.00 | 5 |
| № | ﾚ | Crew | 500m | 1000m | Rank | Qualify |
| 39 5月1日 14:04 予選 ８組 2上り |
1 | |||||
| 2 | 東舞鶴高校B | 3:53.34 | 5 | |||
| 3 | 今治南高校B | 3:43.70 | 3 | |||
| 4 | 今治工業高校C | 3:42.40 | 2 | →準決勝 | ||
| 5 | 京都工学院B | 3:50.00 | 4 | |||
| 6 | 東京選抜 | 3:37.83 | 1 | →準決勝 |
| № | ﾚ | Crew | 500m | 1000m | Rank | Qualify |
| 40 5月1日 14:12 予選 ９組 2上り |
1 | |||||
| 2 | 膳所高校A | 3:27.25 | 1 | →準決勝 | ||
| 3 | 清風高校 | 3:35.96 | 2 | →準決勝 | ||
| 4 | 十津川高校B | 4:06.32 | 4 | |||
| 5 | 長崎明誠高校 | 3:52.21 | 3 | |||
| 6 | 堀川高校C | 4:20.36 | 5 |
| № | ﾚ | Crew | 500m | 1000m | Rank | Qualify |
| 79 5月2日 12:52 敗復 １組 3上り |
1 | |||||
| 2 | 徳島市立高校 | 4:23.61 | 4 | |||
| 3 | 松山東高校A | 4:09.18 | 3 | →準決勝 | ||
| 4 | 東舞鶴高校A | 3:55.44 | 1 | →準決勝 | ||
| 5 | 堀川高校B | 4:08.33 | 2 | →準決勝 | ||
| 6 | 洲本高校 | 4:44.18 | 5 |
| № | ﾚ | Crew | 500m | 1000m | Rank | Qualify |
| 80 5月2日 13:00 敗復 ２組 3上り |
1 | |||||
| 2 | 宮津天橋高校A | 4:22.95 | 5 | |||
| 3 | 今治南高校B | 4:17.48 | 4 | |||
| 4 | 関西高校B | 4:02.25 | 1 | →準決勝 | ||
| 5 | 膳所高校B | 4:09.43 | 2 | →準決勝 | ||
| 6 | 十津川高校B | 4:12.32 | 3 | →準決勝 |
| № | ﾚ | Crew | 500m | 1000m | Rank | Qualify |
| 81 5月2日 13:08 敗復 ３組 3上り |
1 | |||||
| 2 | 東舞鶴高校B | 4:30.90 | 5 | |||
| 3 | 桜宮高校 | 4:13.33 | 2 | →準決勝 | ||
| 4 | 彦根東高校 B | 4:06.12 | 1 | →準決勝 | ||
| 5 | 八幡商業高校 | 4:22.26 | 4 | |||
| 6 | 膳所高校C | 4:19.66 | 3 | →準決勝 |
| № | ﾚ | Crew | 500m | 1000m | Rank | Qualify |
| 82 5月2日 13:16 敗復 ４組 3上り |
1 | 愛媛大学附属B | 4:22.16 | 5 | ||
| 2 | 岡谷南高校B | 4:20.28 | 4 | |||
| 3 | 岡谷南高校A | 4:07.17 | 2 | →準決勝 | ||
| 4 | 今治北高校B | 4:00.59 | 1 | →準決勝 | ||
| 5 | 京都工学院B | 4:16.64 | 3 | →準決勝 | ||
| 6 | 十津川高校A | 4:48.96 | 6 |
| № | ﾚ | Crew | 500m | 1000m | Rank | Qualify |
| 83 5月2日 13:24 敗復 ５組 3上り |
1 | 堀川高校C | 4:50.76 | 5 | ||
| 2 | 長崎明誠高校 | 4:22.23 | 2 | →準決勝 | ||
| 3 | 今治北高校C | 4:30.35 | 4 | |||
| 4 | 大津高校B | 4:12.54 | 1 | →準決勝 | ||
| 5 | 松山東高校B | 4:22.60 | 3 | →準決勝 | ||
| 6 | 宮津天橋高校B | 4:55.61 | 6 |
| № | ﾚ | Crew | 500m | 1000m | Rank | Qualify |
| 117 5月3日 12:20 準決 １組 1上り |
1 | |||||
| 2 | 堀川高校B | 3:41.31 | 4 | |||
| 3 | 今治工業高校B | 3:32.99 | 3 | |||
| 4 | 今治北高校A | 3:26.12 | 1 | →決勝 | ||
| 5 | 清風高校 | 3:30.53 | 2 | |||
| 6 | 松山東高校A | 3:41.55 | 5 |
| № | ﾚ | Crew | 500m | 1000m | Rank | Qualify |
| 118 5月3日 12:28 準決 ２組 1上り |
1 | |||||
| 2 | 岡谷南高校A | 3:37.37 | 3 | |||
| 3 | 高島高校 | 3:28.24 | 2 | |||
| 4 | 膳所高校A | 3:27.33 | 1 | →決勝 | ||
| 5 | 彦根東高校 A | 3:42.21 | 5 | |||
| 6 | 膳所高校B | 3:40.55 | 4 |
| № | ﾚ | Crew | 500m | 1000m | Rank | Qualify |
| 119 5月3日 12:36 準決 ３組 1上り |
1 | |||||
| 2 | 彦根東高校 B | 3:36.90 | 3 | |||
| 3 | 瀬田工業高校 | 3:38.10 | 4 | |||
| 4 | 関西高校A | 3:26.34 | 1 | →決勝 | ||
| 5 | 海洋高校A | 3:35.38 | 2 | |||
| 6 | 十津川高校B | 3:53.48 | 5 |
| № | ﾚ | Crew | 500m | 1000m | Rank | Qualify |
| 120 5月3日 12:44 準決 ４組 1上り |
1 | 松山東高校B | 3:44.34 | 5 | ||
| 2 | 関西高校B | 3:38.36 | 4 | |||
| 3 | 大津高校A | 3:29.95 | 2 | |||
| 4 | 今治工業高校A | 3:24.45 | 1 | →決勝 | ||
| 5 | 東京選抜 | 3:45.67 | 6 | |||
| 6 | 大津高校B | 3:37.85 | 3 |
| № | ﾚ | Crew | 500m | 1000m | Rank | Qualify |
| 121 5月3日 12:52 準決 ５組 1上り |
1 | 長崎明誠高校 | 3:52.72 | 6 | ||
| 2 | 今治北高校B | 3:34.65 | 2 | |||
| 3 | 松江高専 | 3:35.27 | 3 | |||
| 4 | 熊本学園大学付属高校 | 3:29.02 | 1 | →決勝 | ||
| 5 | 愛媛大学附属A | 3:44.84 | 5 | |||
| 6 | 桜宮高校 | 3:36.40 | 4 |
| № | ﾚ | Crew | 500m | 1000m | Rank | Qualify |
| 122 5月3日 13:00 準決 ６組 1上り |
1 | 膳所高校C | 3:54.77 | 5 | ||
| 2 | 東舞鶴高校A | 3:34.07 | 3 | |||
| 3 | 海洋高校B | 3:25.55 | 1 | →決勝 | ||
| 4 | 京都工学院A | 3:28.94 | 2 | |||
| 5 | 今治工業高校C | 3:44.82 | 4 | |||
| 6 | 京都工学院B | DNS |
| № | ﾚ | Crew | 500m | 1000m | Rank | Qualify |
| 141 5月4日 10:20 決勝 |
1 | 熊本学園大学付属高校 | 3:24.48 | 4 | ||
| 2 | 関西高校A | 3:19.65 | 1 | |||
| 3 | 海洋高校B | 3:22.13 | 2 | |||
| 4 | 今治工業高校A | 3:25.69 | 5 | |||
| 5 | 今治北高校A | 3:31.37 | 6 | |||
| 6 | 膳所高校A | 3:24.30 | 3 |