| № | BNo | Crew | 500m | 1000m | Rank | Qualify |
| 1 5月3日 8:00 予選 １組 2上り |
1 | 滝口 靖幸(海洋高校A) | 3:55.11 | 1 | →準決勝 | |
| 2 | 篠原 一透(今治工業高校B) | 4:39.28 | 5 | |||
| 3 | 佐橋 泰輝(京都工学院B) | 4:13.92 | 4 | |||
| 4 | 西村 吉生(膳所高校Ａ) | 4:11.67 | 3 | |||
| 5 | 川下 瑞暉(七尾高校) | 5:06.41 | 6 | |||
| 6 | 岡本 侑大(宇和島東高校A) | 4:03.07 | 2 | →準決勝 |
| № | BNo | Crew | 500m | 1000m | Rank | Qualify |
| 2 5月3日 8:08 予選 ２組 2上り |
1 | 魚井 颯太(洲本高校) | 4:06.93 | 1 | →準決勝 | |
| 2 | 伊藤 奏芽(彦根東高校) | 4:14.21 | 3 | |||
| 3 | 宇都宮 保純(宇和島東高校B) | 4:07.04 | 2 | →準決勝 | ||
| 4 | 吉川 輝竜(堀川高校B) | 4:51.34 | 6 | |||
| 5 | 南 続(朱雀高校B) | 4:45.49 | 5 | |||
| 6 | 鈴木 希良(海洋高校C) | 4:40.97 | 4 |
| № | BNo | Crew | 500m | 1000m | Rank | Qualify |
| 3 5月3日 8:16 予選 ３組 2上り |
1 | 石井 伯尚(相可高校B) | 4:38.31 | 4 | ||
| 2 | 延時 大智(東京選抜B) | DNS | ||||
| 3 | 香田 竜成(長崎明誠高校A) | 3:56.11 | 1 | →準決勝 | ||
| 4 | 坪田 悠成(関西高校B) | 4:13.78 | 3 | |||
| 5 | 仙田 荘士(清風高校) | 3:58.57 | 2 | →準決勝 | ||
| 6 | 花岡 智稀(岡谷南高校B) | DNS |
| № | BNo | Crew | 500m | 1000m | Rank | Qualify |
| 4 5月3日 8:24 予選 ４組 2上り |
1 | 都築 歩(高島高校) | 4:18.75 | 6 | ||
| 2 | 小林 悠真(津高校) | 4:11.05 | 5 | |||
| 3 | 余戝 颯祐(大津高校B) | 4:09.07 | 4 | |||
| 4 | 眞鍋 愛琉(今治南高校A) | 3:51.01 | 1 | →準決勝 | ||
| 5 | 西川 元喜(京都工学院A) | 3:51.79 | 2 | →準決勝 | ||
| 6 | 出田 修也(熊本学園大学付属高校B) | 4:03.63 | 3 |
| № | BNo | Crew | 500m | 1000m | Rank | Qualify |
| 5 5月3日 8:32 予選 ５組 2上り |
1 | 三木 孔明ｳｫﾙﾀｰ(海洋高校B) | DNS | |||
| 2 | 小林 蒼太朗(岡谷南高校A) | 4:07.03 | 1 | →準決勝 | ||
| 3 | 北相模 拓海(八幡商業高校) | 4:14.61 | 2 | →準決勝 | ||
| 4 | 福嶋 大己(膳所高校Ｃ) | 4:29.86 | 3 | |||
| 5 | 山中 尋翔(今治南高校B) | DNS | ||||
| 6 |
| № | BNo | Crew | 500m | 1000m | Rank | Qualify |
| 6 5月3日 8:40 予選 ６組 2上り |
1 | 矢村 怜久(滋賀選抜) | 3:58.20 | 2 | →準決勝 | |
| 2 | 野田 照磨(熊本学園大学付属高校A) | 3:52.27 | 1 | →準決勝 | ||
| 3 | 村上 遥大(大村高校) | DNS | ||||
| 4 | 小笠原 優希(松山東高校B) | 3:59.26 | 3 | |||
| 5 | 原田 悠優太(琵琶湖漕艇場BRC) | 4:03.83 | 4 | |||
| 6 |
| № | BNo | Crew | 500m | 1000m | Rank | Qualify |
| 7 5月3日 8:48 予選 ７組 2上り |
1 | 福島 快悠(長崎明誠高校B) | 4:16.77 | 4 | ||
| 2 | 大瀧 将叶(相可高校A) | 4:09.98 | 3 | |||
| 3 | 伊藤 諒成(松山東高校A) | 3:58.19 | 1 | →準決勝 | ||
| 4 | 桑原 健太(堀川高校A) | 4:04.80 | 2 | →準決勝 | ||
| 5 | 吉田 翼(徳島市立B) | 4:35.93 | 5 | |||
| 6 |
| № | BNo | Crew | 500m | 1000m | Rank | Qualify |
| 8 5月3日 8:56 予選 ８組 2上り |
1 | 橘 夢久(膳所高校Ｂ) | 4:19.47 | 4 | ||
| 2 | 楠 泰成(宮津天橋高校) | DNS | ||||
| 3 | 作本 蓮心(徳島市立A) | 3:59.03 | 2 | →準決勝 | ||
| 4 | 前田 拓生(大津高校A) | 3:57.77 | 1 | →準決勝 | ||
| 5 | 三上 元輝(朱雀高校A) | 4:04.65 | 3 | |||
| 6 |
| № | BNo | Crew | 500m | 1000m | Rank | Qualify |
| 9 5月3日 9:04 予選 ９組 2上り |
1 | 内田 康太郎(東京選抜A) | 4:10.85 | 3 | ||
| 2 | 片山 祐輔(今治工業高校A) | 4:54.29 | 5 | |||
| 3 | 西村 友佑(関西高校A) | 4:03.14 | 2 | →準決勝 | ||
| 4 | 小玉 将太朗(松江高専) | 4:29.29 | 4 | |||
| 5 | 田中 洋輝(愛媛大学附属) | 4:01.37 | 1 | →準決勝 | ||
| 6 |
| № | BNo | Crew | 500m | 1000m | Rank | Qualify |
| 39 5月3日 13:04 敗復 １組 3上り |
1 | 篠原 一透(今治工業高校B) | 4:31.98 | 4 | ||
| 2 | 坪田 悠成(関西高校B) | 4:21.69 | 3 | →準決勝 | ||
| 3 | 小笠原 優希(松山東高校B) | 4:10.58 | 1 | →準決勝 | ||
| 4 | 佐橋 泰輝(京都工学院B) | 4:16.13 | 2 | →準決勝 | ||
| 5 | 鈴木 希良(海洋高校C) | 4:42.92 | 5 | |||
| 6 |
| № | BNo | Crew | 500m | 1000m | Rank | Qualify |
| 40 5月3日 13:12 敗復 ２組 3上り |
1 | 石井 伯尚(相可高校B) | 4:41.56 | 4 | ||
| 2 | 西村 吉生(膳所高校Ａ) | 4:11.20 | 2 | →準決勝 | ||
| 3 | 出田 修也(熊本学園大学付属高校B) | 4:06.81 | 1 | →準決勝 | ||
| 4 | 伊藤 奏芽(彦根東高校) | 4:17.00 | 3 | →準決勝 | ||
| 5 | 南 続(朱雀高校B) | 4:49.68 | 5 | |||
| 6 |
| № | BNo | Crew | 500m | 1000m | Rank | Qualify |
| 41 5月3日 13:20 敗復 ３組 3上り |
1 | 吉田 翼(徳島市立B) | 4:36.92 | 4 | ||
| 2 | 小林 悠真(津高校) | 4:19.52 | 2 | →準決勝 | ||
| 3 | 原田 悠優太(琵琶湖漕艇場BRC) | 4:13.54 | 1 | →準決勝 | ||
| 4 | 福島 快悠(長崎明誠高校B) | 4:24.97 | 3 | →準決勝 | ||
| 5 | 吉川 輝竜(堀川高校B) | 4:41.72 | 5 | |||
| 6 |
| № | BNo | Crew | 500m | 1000m | Rank | Qualify |
| 42 5月3日 13:28 敗復 ４組 3上り |
1 | 福嶋 大己(膳所高校Ｃ) | 4:31.22 | 4 | ||
| 2 | 内田 康太郎(東京選抜A) | 4:25.15 | 3 | →準決勝 | ||
| 3 | 三上 元輝(朱雀高校A) | 4:07.19 | 1 | →準決勝 | ||
| 4 | 都築 歩(高島高校) | 4:11.95 | 2 | →準決勝 | ||
| 5 | 片山 祐輔(今治工業高校A) | 5:08.84 | 5 | |||
| 6 |
| № | BNo | Crew | 500m | 1000m | Rank | Qualify |
| 43 5月3日 13:36 敗復 ５組 3上り |
1 | 小玉 将太朗(松江高専) | 5:08.98 | 5 | ||
| 2 | 大瀧 将叶(相可高校A) | 4:16.92 | 2 | →準決勝 | ||
| 3 | 余戝 颯祐(大津高校B) | 4:14.23 | 1 | →準決勝 | ||
| 4 | 橘 夢久(膳所高校Ｂ) | 4:22.53 | 3 | →準決勝 | ||
| 5 | 川下 瑞暉(七尾高校) | 4:51.18 | 4 | |||
| 6 |
| № | BNo | Crew | 500m | 1000m | Rank | Qualify |
| 65 5月4日 8:00 準決 １組 1上り |
1 | 原田 悠優太(琵琶湖漕艇場BRC) | 4:00.17 | 3 | ||
| 2 | 岡本 侑大(宇和島東高校A) | 3:42.12 | 1 | →決勝 | ||
| 3 | 眞鍋 愛琉(今治南高校A) | 3:49.55 | 2 | |||
| 4 | 西村 友佑(関西高校A) | 4:11.99 | 5 | |||
| 5 | 余戝 颯祐(大津高校B) | 4:02.32 | 4 | |||
| 6 |
| № | BNo | Crew | 500m | 1000m | Rank | Qualify |
| 66 5月4日 8:08 準決 ２組 1上り |
1 | 都築 歩(高島高校) | 3:59.88 | 4 | ||
| 2 | 田中 洋輝(愛媛大学附属) | 3:57.20 | 3 | |||
| 3 | 西川 元喜(京都工学院A) | 3:47.71 | 1 | →決勝 | ||
| 4 | 桑原 健太(堀川高校A) | 3:56.35 | 2 | |||
| 5 | 佐橋 泰輝(京都工学院B) | 4:02.91 | 5 | |||
| 6 |
| № | BNo | Crew | 500m | 1000m | Rank | Qualify |
| 67 5月4日 8:16 準決 ３組 1上り |
1 | 西村 吉生(膳所高校Ａ) | 4:01.22 | 5 | ||
| 2 | 作本 蓮心(徳島市立A) | 3:48.40 | 2 | |||
| 3 | 野田 照磨(熊本学園大学付属高校A) | 3:46.08 | 1 | →決勝 | ||
| 4 | 魚井 颯太(洲本高校) | 3:51.91 | 3 | |||
| 5 | 大瀧 将叶(相可高校A) | 3:56.92 | 4 | |||
| 6 |
| № | BNo | Crew | 500m | 1000m | Rank | Qualify |
| 68 5月4日 8:24 準決 ４組 1上り |
1 | 内田 康太郎(東京選抜A) | 4:06.39 | 6 | ||
| 2 | 小笠原 優希(松山東高校B) | 3:53.50 | 3 | |||
| 3 | 仙田 荘士(清風高校) | 3:46.25 | 2 | |||
| 4 | 滝口 靖幸(海洋高校A) | 3:41.24 | 1 | →決勝 | ||
| 5 | 小林 蒼太朗(岡谷南高校A) | 3:57.55 | 4 | |||
| 6 | 伊藤 奏芽(彦根東高校) | 4:02.93 | 5 |
| № | BNo | Crew | 500m | 1000m | Rank | Qualify |
| 69 5月4日 8:32 準決 ５組 1上り |
1 | 福島 快悠(長崎明誠高校B) | 4:12.17 | 6 | ||
| 2 | 三上 元輝(朱雀高校A) | 3:57.68 | 4 | |||
| 3 | 矢村 怜久(滋賀選抜) | 3:50.17 | 2 | |||
| 4 | 香田 竜成(長崎明誠高校A) | 3:45.87 | 1 | →決勝 | ||
| 5 | 宇都宮 保純(宇和島東高校B) | 3:56.53 | 3 | |||
| 6 | 小林 悠真(津高校) | 4:01.33 | 5 |
| № | BNo | Crew | 500m | 1000m | Rank | Qualify |
| 70 5月4日 8:40 準決 ６組 1上り |
1 | 橘 夢久(膳所高校Ｂ) | 4:08.06 | 6 | ||
| 2 | 出田 修也(熊本学園大学付属高校B) | 3:48.68 | 3 | |||
| 3 | 伊藤 諒成(松山東高校A) | 3:46.52 | 1 | →決勝 | ||
| 4 | 前田 拓生(大津高校A) | 3:48.62 | 2 | |||
| 5 | 北相模 拓海(八幡商業高校) | 3:58.30 | 4 | |||
| 6 | 坪田 悠成(関西高校B) | 4:02.98 | 5 |
| № | BNo | Crew | 500m | 1000m | Rank | Qualify |
| 94 5月4日 12:30 決勝 |
1 | 西川 元喜(京都工学院A) | 3:41.53 | 2 | ||
| 2 | 野田 照磨(熊本学園大学付属高校A) | 3:51.68 | 4 | |||
| 3 | 岡本 侑大(宇和島東高校A) | 3:47.04 | 3 | |||
| 4 | 滝口 靖幸(海洋高校A) | 3:37.82 | 1 | |||
| 5 | 香田 竜成(長崎明誠高校A) | 6 | DNS | |||
| 6 | 伊藤 諒成(松山東高校A) | 3:58.80 | 5 |