| № | BNo | Crew | 500m | 1000m | Rank | Qualify |
| 20 5月3日 10:32 予選 １組 2上り |
1 | 大村高校C | 3:46.29 | 5 | ||
| 2 | 膳所高校Ａ | 3:26.44 | 1 | →準決勝 | ||
| 3 | 今治工業高校A | 3:36.88 | 3 | |||
| 4 | 東京選抜B | 3:32.80 | 2 | →準決勝 | ||
| 5 | 高島高校 | 3:37.09 | 4 | |||
| 6 | 徳島市立B | DNS |
| № | BNo | Crew | 500m | 1000m | Rank | Qualify |
| 21 5月3日 10:40 予選 ２組 2上り |
1 | 今治南高校 | 3:53.19 | 6 | ||
| 2 | 彦根東高校 | 3:35.48 | 2 | →準決勝 | ||
| 3 | 東京選抜D | 3:52.08 | 5 | |||
| 4 | 今治工業高校B | 3:32.95 | 1 | →準決勝 | ||
| 5 | 徳島市立A | 3:51.86 | 4 | |||
| 6 | 東舞鶴高校A | 3:48.52 | 3 |
| № | BNo | Crew | 500m | 1000m | Rank | Qualify |
| 22 5月3日 10:48 予選 ３組 2上り |
1 | 今治北高校 | 3:34.54 | 2 | →準決勝 | |
| 2 | 松山東高校C | 3:51.06 | 5 | |||
| 3 | 京都工学院D | 3:59.62 | 6 | |||
| 4 | 関西高校A | 3:24.86 | 1 | →準決勝 | ||
| 5 | 長崎明誠高校 | 3:46.41 | 4 | |||
| 6 | 相可高校A | 3:35.08 | 3 |
| № | BNo | Crew | 500m | 1000m | Rank | Qualify |
| 23 5月3日 10:56 予選 ４組 2上り |
1 | 熊本学園大学付属高校A | 3:34.42 | 1 | →準決勝 | |
| 2 | 海洋高校B | 3:35.66 | 2 | →準決勝 | ||
| 3 | 京都工学院B | DNS | ||||
| 4 | 瀬田工業高校 | 3:38.31 | 3 | |||
| 5 | 東京選抜F | 3:45.89 | 4 | |||
| 6 | 津高校 | 4:04.41 | 5 |
| № | BNo | Crew | 500m | 1000m | Rank | Qualify |
| 24 5月3日 11:04 予選 ５組 2上り |
1 | 宮津天橋高校 | DNS | |||
| 2 | 東京選抜C | 3:40.95 | 2 | →準決勝 | ||
| 3 | 東舞鶴高校C | 3:59.39 | 4 | |||
| 4 | 膳所高校Ｃ | 4:08.91 | 5 | |||
| 5 | 松山東高校A | 3:35.22 | 1 | →準決勝 | ||
| 6 | 大津高校 | 3:54.33 | 3 |
| № | BNo | Crew | 500m | 1000m | Rank | Qualify |
| 25 5月3日 11:12 予選 ６組 2上り |
1 | 東舞鶴高校B | 3:50.29 | 4 | ||
| 2 | 相可高校B | 3:43.07 | 2 | →準決勝 | ||
| 3 | 琵琶湖漕艇場BRC-A | 3:41.60 | 1 | →準決勝 | ||
| 4 | 大村高校B | 3:47.34 | 3 | |||
| 5 | 愛媛大学附属 | 4:27.87 | 6 | |||
| 6 | 堀川高校C | 4:10.37 | 5 |
| № | BNo | Crew | 500m | 1000m | Rank | Qualify |
| 26 5月3日 11:20 予選 ７組 2上り |
1 | 琵琶湖漕艇場BRC-B | 3:42.39 | 1 | →準決勝 | |
| 2 | 今治工業高校C | 3:42.67 | 2 | →準決勝 | ||
| 3 | 膳所高校Ｂ | 4:24.47 | 5 | |||
| 4 | 熊本学園大学付属高校B | 3:52.09 | 4 | |||
| 5 | 岡谷南高校A | 3:49.81 | 3 | |||
| 6 |
| № | BNo | Crew | 500m | 1000m | Rank | Qualify |
| 27 5月3日 11:28 予選 ８組 2上り |
1 | 滋賀選抜 | 3:35.57 | 1 | →準決勝 | |
| 2 | 堀川高校A | 4:05.06 | 3 | |||
| 3 | 宇和島東高校 | 3:43.81 | 2 | →準決勝 | ||
| 4 | 東京選抜A | 5:11.84 | 5 | |||
| 5 | 岡谷南高校B | 4:08.00 | 4 | |||
| 6 |
| № | BNo | Crew | 500m | 1000m | Rank | Qualify |
| 28 5月3日 11:36 予選 ９組 2上り |
1 | 東京選抜E | 4:04.22 | 5 | ||
| 2 | 松山東高校B | 3:44.42 | 2 | →準決勝 | ||
| 3 | 京都工学院C | 4:00.97 | 4 | |||
| 4 | 今治工業高校D | 3:57.27 | 3 | |||
| 5 | 清風高校 | 3:27.88 | 1 | →準決勝 | ||
| 6 |
| № | BNo | Crew | 500m | 1000m | Rank | Qualify |
| 29 5月3日 11:44 予選 10組 2上り |
1 | 京都工学院A | 3:53.23 | 3 | ||
| 2 | 海洋高校A | 3:50.61 | 2 | →準決勝 | ||
| 3 | 関西高校B | 3:53.88 | 4 | |||
| 4 | 大村高校Ａ | 3:37.96 | 1 | →準決勝 | ||
| 5 | 堀川高校B | 4:05.03 | 5 | |||
| 6 |
| № | BNo | Crew | 500m | 1000m | Rank | Qualify |
| 52 5月3日 14:48 敗復 １組 2上り |
1 | 東京選抜E | 4:40.14 | 5 | ||
| 2 | 松山東高校C | 4:16.45 | 2 | →準決勝 | ||
| 3 | 相可高校A | 4:12.13 | 1 | →準決勝 | ||
| 4 | 徳島市立A | 4:23.01 | 3 | |||
| 5 | 津高校 | 4:39.74 | 4 | |||
| 6 |
| № | BNo | Crew | 500m | 1000m | Rank | Qualify |
| 53 5月3日 14:56 敗復 ２組 2上り |
1 | 京都工学院C | 4:23.67 | 3 | ||
| 2 | 東舞鶴高校B | 4:12.63 | 2 | →準決勝 | ||
| 3 | 今治工業高校A | 4:11.70 | 1 | →準決勝 | ||
| 4 | 東京選抜D | 4:26.02 | 4 | |||
| 5 | 堀川高校B | 4:31.18 | 5 | |||
| 6 |
| № | BNo | Crew | 500m | 1000m | Rank | Qualify |
| 54 5月3日 15:04 敗復 ３組 2上り |
1 | 京都工学院D | 4:34.14 | 5 | ||
| 2 | 岡谷南高校A | 4:22.58 | 3 | |||
| 3 | 高島高校 | 4:18.96 | 1 | →準決勝 | ||
| 4 | 熊本学園大学付属高校B | 4:20.74 | 2 | →準決勝 | ||
| 5 | 堀川高校A | 4:28.63 | 4 | |||
| 6 |
| № | BNo | Crew | 500m | 1000m | Rank | Qualify |
| 55 5月3日 15:12 敗復 ４組 2上り |
1 | 東京選抜A | 4:19.21 | 3 | ||
| 2 | 東舞鶴高校C | 4:22.88 | 4 | |||
| 3 | 東舞鶴高校A | 4:14.39 | 2 | →準決勝 | ||
| 4 | 瀬田工業高校 | 4:07.95 | 1 | →準決勝 | ||
| 5 | 今治南高校 | 4:25.48 | 5 | |||
| 6 | 岡谷南高校B | 4:29.88 | 6 |
| № | BNo | Crew | 500m | 1000m | Rank | Qualify |
| 56 5月3日 15:20 敗復 ５組 2上り |
1 | 愛媛大学附属 | 4:41.52 | 6 | ||
| 2 | 今治工業高校D | 4:13.51 | 3 | |||
| 3 | 大村高校B | 4:07.21 | 2 | →準決勝 | ||
| 4 | 東京選抜F | 4:17.60 | 4 | |||
| 5 | 京都工学院A | 4:06.66 | 1 | →準決勝 | ||
| 6 | 膳所高校Ｃ | 4:35.04 | 5 |
| № | BNo | Crew | 500m | 1000m | Rank | Qualify |
| 57 5月3日 15:28 敗復 ６組 2上り |
1 | 膳所高校Ｂ | 4:46.75 | 5 | ||
| 2 | 大津高校 | 4:26.25 | 4 | |||
| 3 | 長崎明誠高校 | 4:14.84 | 1 | →準決勝 | ||
| 4 | 大村高校C | 4:18.75 | 2 | →準決勝 | ||
| 5 | 関西高校B | 4:24.15 | 3 | |||
| 6 | 堀川高校C | 4:57.32 | 6 |
| № | BNo | Crew | 500m | 1000m | Rank | Qualify |
| 77 5月4日 9:36 準決 １組 1上り |
1 | 今治工業高校A | 3:35.92 | 4 | ||
| 2 | 大村高校Ａ | 3:21.41 | 2 | |||
| 3 | 関西高校A | 3:19.69 | 1 | →決勝 | ||
| 4 | 東京選抜C | 3:41.12 | 5 | |||
| 5 | 相可高校A | 3:28.91 | 3 | |||
| 6 |
| № | BNo | Crew | 500m | 1000m | Rank | Qualify |
| 78 5月4日 9:44 準決 ２組 1上り |
1 | 瀬田工業高校 | 3:34.22 | 5 | ||
| 2 | 海洋高校B | 3:27.97 | 2 | |||
| 3 | 膳所高校Ａ | 3:23.06 | 1 | →決勝 | ||
| 4 | 琵琶湖漕艇場BRC-A | 3:33.65 | 3 | |||
| 5 | 東舞鶴高校B | 3:33.93 | 4 | |||
| 6 |
| № | BNo | Crew | 500m | 1000m | Rank | Qualify |
| 79 5月4日 9:52 準決 ３組 1上り |
1 | 大村高校B | 3:37.26 | 5 | ||
| 2 | 滋賀選抜 | 3:19.31 | 2 | |||
| 3 | 清風高校 | 3:18.20 | 1 | →決勝 | ||
| 4 | 琵琶湖漕艇場BRC-B | 3:29.83 | 3 | |||
| 5 | 東舞鶴高校A | 3:36.22 | 4 | |||
| 6 |
| № | BNo | Crew | 500m | 1000m | Rank | Qualify |
| 80 5月4日 10:00 準決 ４組 1上り |
1 | 京都工学院A | 3:50.14 | 5 | ||
| 2 | 彦根東高校 | 3:28.32 | 1 | →決勝 | ||
| 3 | 東京選抜B | 3:31.78 | 2 | |||
| 4 | 今治工業高校C | 3:32.11 | 3 | |||
| 5 | 長崎明誠高校 | 3:36.39 | 4 | |||
| 6 |
| № | BNo | Crew | 500m | 1000m | Rank | Qualify |
| 81 5月4日 10:08 準決 ５組 1上り |
1 | 熊本学園大学付属高校B | 3:41.96 | 6 | ||
| 2 | 海洋高校A | 3:35.02 | 3 | |||
| 3 | 松山東高校A | 3:31.54 | 2 | |||
| 4 | 今治工業高校B | 3:27.59 | 1 | →決勝 | ||
| 5 | 相可高校B | 3:39.36 | 5 | |||
| 6 | 松山東高校C | 3:38.24 | 4 |
| № | BNo | Crew | 500m | 1000m | Rank | Qualify |
| 82 5月4日 10:16 準決 ６組 1上り |
1 | 高島高校 | 3:34.63 | 5 | ||
| 2 | 松山東高校B | 3:32.77 | 2 | |||
| 3 | 今治北高校 | 3:34.41 | 4 | |||
| 4 | 熊本学園大学付属高校A | 3:31.48 | 1 | →決勝 | ||
| 5 | 宇和島東高校 | 3:34.04 | 3 | |||
| 6 | 大村高校C | 3:42.91 | 6 |
| № | BNo | Crew | 500m | 1000m | Rank | Qualify |
| 96 5月4日 12:50 決勝 |
1 | 熊本学園大学付属高校A | 3:30.26 | 4 | ||
| 2 | 今治工業高校B | 3:24.57 | 2 | |||
| 3 | 関西高校A | 3:21.85 | 1 | |||
| 4 | 清風高校 | 3:25.34 | 3 | |||
| 5 | 膳所高校Ａ | 3:30.56 | 5 | |||
| 6 | 彦根東高校 | 3:32.92 | 6 |