| № | ﾚ | Crew | 500m | 1000m | Rank | Qualify |
| 45 5月1日 14:52 予選 １組 2上り |
1 | 桜宮高校 | 3:27.36 | 3 | ||
| 2 | 徳島市立高校 | 3:32.77 | 4 | |||
| 3 | 和歌山県立桐蔭高校 | 3:35.41 | 6 | |||
| 4 | 膳所高校A | 3:23.22 | 1 | →準決勝 | ||
| 5 | 彦根東高校 | 3:33.05 | 5 | |||
| 6 | 熊本学園大学付属高校A | 3:27.20 | 2 | →準決勝 |
| № | ﾚ | Crew | 500m | 1000m | Rank | Qualify |
| 46 5月1日 15:00 予選 ２組 2上り |
1 | 膳所高校B | 3:37.66 | 4 | ||
| 2 | 岡谷南高校B | 3:41.43 | 6 | |||
| 3 | 高石高校B | 3:31.81 | 2 | →準決勝 | ||
| 4 | 洲本高校 | 3:41.04 | 5 | |||
| 5 | 今治北高校 | 3:32.42 | 3 | |||
| 6 | 東京選抜A | 3:24.41 | 1 | →準決勝 |
| № | ﾚ | Crew | 500m | 1000m | Rank | Qualify |
| 47 5月1日 15:08 予選 ３組 2上り |
1 | 津高校 | 3:35.53 | 4 | ||
| 2 | 松山東高校 | 3:27.59 | 3 | |||
| 3 | 堀川高校 | 3:45.44 | 6 | 除外 | ||
| 4 | 高石高校A | 3:25.62 | 2 | →準決勝 | ||
| 5 | 清風高校B | 3:40.25 | 5 | |||
| 6 | 京都工学院A | 3:22.28 | 1 | →準決勝 |
| № | ﾚ | Crew | 500m | 1000m | Rank | Qualify |
| 48 5月1日 15:16 予選 ４組 2上り |
1 | 清風高校A | 3:19.90 | 1 | →準決勝 | |
| 2 | 和歌山北高校 | 3:31.86 | 4 | |||
| 3 | 京都工学院B | 3:32.09 | 5 | |||
| 4 | 八幡商業高校 | 3:45.44 | 6 | |||
| 5 | 東京選抜B | 3:26.79 | 2 | →準決勝 | ||
| 6 | 長崎明誠高校 | 3:27.97 | 3 |
| № | ﾚ | Crew | 500m | 1000m | Rank | Qualify |
| 49 5月1日 15:24 予選 ５組 2上り |
1 | 膳所高校C | 3:43.81 | 6 | ||
| 2 | 東舞鶴高校 | 3:30.24 | 4 | |||
| 3 | 大津高校 | 3:21.66 | 2 | →準決勝 | ||
| 4 | 関西高校 | 3:19.51 | 1 | →準決勝 | ||
| 5 | 今治工業高校 | 3:40.73 | 5 | |||
| 6 | 岡谷南高校A | 3:25.32 | 3 |
| № | ﾚ | Crew | 500m | 1000m | Rank | Qualify |
| 87 5月2日 13:56 敗復 １組 2上り |
1 | |||||
| 2 | 洲本高校 | 3:36.03 | 4 | |||
| 3 | 今治北高校 | 3:29.44 | 3 | |||
| 4 | 岡谷南高校A | 3:24.06 | 1 | →準決勝 | ||
| 5 | 徳島市立高校 | 3:27.85 | 2 | →準決勝 | ||
| 6 | 岡谷南高校B | 3:38.26 | 5 |
| № | ﾚ | Crew | 500m | 1000m | Rank | Qualify |
| 88 5月2日 14:04 敗復 ２組 2上り |
1 | |||||
| 2 | 今治工業高校 | 3:36.15 | 4 | |||
| 3 | 京都工学院B | 3:29.58 | 3 | |||
| 4 | 桜宮高校 | 3:21.39 | 1 | →準決勝 | ||
| 5 | 彦根東高校 | 3:27.13 | 2 | →準決勝 | ||
| 6 | 膳所高校C | 3:40.59 | 5 |
| № | ﾚ | Crew | 500m | 1000m | Rank | Qualify |
| 89 5月2日 14:12 敗復 ３組 2上り |
1 | |||||
| 2 | 清風高校B | 3:35.45 | 4 | |||
| 3 | 和歌山北高校 | 3:33.82 | 3 | |||
| 4 | 松山東高校 | 3:28.79 | 1 | →準決勝 | ||
| 5 | 和歌山県立桐蔭高校 | 3:31.12 | 2 | →準決勝 | ||
| 6 | 八幡商業高校 | 3:50.06 | 5 |
| № | ﾚ | Crew | 500m | 1000m | Rank | Qualify |
| 90 5月2日 14:20 敗復 ４組 2上り |
1 | |||||
| 2 | 膳所高校B | 3:42.67 | 4 | |||
| 3 | 東舞鶴高校 | 3:31.37 | 2 | →準決勝 | ||
| 4 | 長崎明誠高校 | 3:28.87 | 1 | →準決勝 | ||
| 5 | 津高校 | 3:33.71 | 3 | |||
| 6 | 堀川高校 | 4:03.28 | 5 |
| № | ﾚ | Crew | 500m | 1000m | Rank | Qualify |
| 126 5月3日 13:34 準決 １組 2上り |
1 | 東舞鶴高校 | 3:47.88 | 5 | ||
| 2 | 岡谷南高校A | 3:29.92 | 3 | |||
| 3 | 東京選抜A | 3:16.60 | 2 | →決勝 | ||
| 4 | 関西高校 | 3:14.94 | 1 | →決勝 | ||
| 5 | 高石高校A | DNS | ||||
| 6 | 彦根東高校 | 3:40.60 | 4 |
| № | ﾚ | Crew | 500m | 1000m | Rank | Qualify |
| 127 5月3日 13:42 準決 ２組 2上り |
1 | 和歌山県立桐蔭高校 | 3:27.53 | 5 | ||
| 2 | 桜宮高校 | 3:25.60 | 4 | |||
| 3 | 膳所高校A | 3:20.52 | 2 | →決勝 | ||
| 4 | 清風高校A | 3:18.59 | 1 | →決勝 | ||
| 5 | 東京選抜B | 3:24.92 | 3 | |||
| 6 | 徳島市立高校 | 4:56.05 | 6 |
| № | ﾚ | Crew | 500m | 1000m | Rank | Qualify |
| 128 5月3日 13:50 準決 ３組 2上り |
1 | 長崎明誠高校 | 3:29.42 | 5 | ||
| 2 | 高石高校B | 3:30.08 | 6 | |||
| 3 | 京都工学院A | 3:18.15 | 1 | →決勝 | ||
| 4 | 大津高校 | 3:20.57 | 2 | →決勝 | ||
| 5 | 熊本学園大学付属高校A | 3:23.75 | 3 | |||
| 6 | 松山東高校 | 3:27.16 | 4 |
| № | ﾚ | Crew | 500m | 1000m | Rank | Qualify |
| 145 5月4日 10:52 決勝 |
1 | 大津高校 | 3:13.21 | 5 | ||
| 2 | 清風高校A | 3:11.34 | 3 | |||
| 3 | 東京選抜A | 3:10.03 | 2 | |||
| 4 | 関西高校 | 3:11.78 | 4 | |||
| 5 | 京都工学院A | 3:08.61 | 1 | |||
| 6 | 膳所高校A | 3:14.06 | 6 |