| № | BNo | Crew | 500m | 1000m | Rank | Qualify |
| 10 5月3日 9:12 予選 １組 2上り |
1 | 岸田 慶次郎(高島高校) | 4:15.62 | 5 | ||
| 2 | 越智 勇登(今治北高校大三島分校) | 3:49.10 | 2 | →準決勝 | ||
| 3 | 片山 陸(膳所高校Ａ) | 3:55.74 | 3 | |||
| 4 | 重田 幸希人(東舞鶴高校Ｂ) | 4:05.17 | 4 | |||
| 5 | 太田 哲惺(堀川高校Ａ) | 3:44.09 | 1 | →準決勝 | ||
| 6 | 齊藤 維月(京都工学院Ｂ) | 4:16.03 | 6 |
| № | BNo | Crew | 500m | 1000m | Rank | Qualify |
| 11 5月3日 9:20 予選 ２組 2上り |
1 | 中川 輝大(宇和島東高校) | 3:48.36 | 2 | →準決勝 | |
| 2 | 田畑 翔悟(東京選抜Ｃ) | DNS | ||||
| 3 | 原 颯太郎(膳所高校Ｂ) | 4:27.80 | 5 | |||
| 4 | 浦 琉介(和歌山北高校) | 3:54.88 | 3 | |||
| 5 | 野中 翔一郎(京都工学院Ａ) | 3:57.01 | 4 | |||
| 6 | 川口 真巧(長崎明誠高校) | 3:46.73 | 1 | →準決勝 |
| № | BNo | Crew | 500m | 1000m | Rank | Qualify |
| 12 5月3日 9:28 予選 ３組 2上り |
1 | 河田 兼作(宮津天橋高校Ｂ) | 4:02.72 | 3 | ||
| 2 | 漁 太良(洲本高校) | 6:11.30 | 5 | |||
| 3 | 渡辺 将太(岡谷南高校Ｃ) | 3:52.93 | 1 | →準決勝 | ||
| 4 | 田所 凌空(膳所高校Ｃ) | 4:03.38 | 4 | |||
| 5 | 衛藤 大知(海洋高校Ａ) | 3:58.18 | 2 | →準決勝 | ||
| 6 |
| № | BNo | Crew | 500m | 1000m | Rank | Qualify |
| 13 5月3日 9:36 予選 ４組 2上り |
1 | 米田 翼(桐蔭高校Ａ) | DNS | |||
| 2 | 山村 龍之介(愛媛大学附属高校) | 3:57.83 | 2 | →準決勝 | ||
| 3 | 小谷 悠真(桜宮高校) | 3:52.91 | 1 | →準決勝 | ||
| 4 | 山之内 蒼樹(早稲田大学高等学院) | DNS | ||||
| 5 | 永峯 颯大(東京選抜Ａ) | 4:05.42 | 3 | |||
| 6 |
| № | BNo | Crew | 500m | 1000m | Rank | Qualify |
| 14 5月3日 9:44 予選 ５組 2上り |
1 | 柴田 一景(宮津天橋高校Ａ) | 3:46.90 | 2 | →準決勝 | |
| 2 | 真木 鈴太朗(今治北高校Ｂ) | 3:57.80 | 4 | |||
| 3 | 橋本 航輝(徳島市立高校) | 3:55.74 | 3 | |||
| 4 | 濵田 琉哉(東舞鶴高校Ａ) | 3:42.01 | 1 | →準決勝 | ||
| 5 | 塩田 奈由太(彦根東高校) | 4:08.64 | 5 | |||
| 6 |
| № | BNo | Crew | 500m | 1000m | Rank | Qualify |
| 15 5月3日 9:52 予選 ６組 2上り |
1 | 松澤 晃士(松山東高校) | 3:50.91 | 3 | ||
| 2 | 柏野 泰智(関西高校Ａ) | 3:42.31 | 1 | →準決勝 | ||
| 3 | 米久 澪弥(十津川高校) | 3:53.50 | 4 | |||
| 4 | 村上 巧馬(高島高校) | 3:54.00 | 5 | |||
| 5 | 福本 心(熊本学園大学付属高校Ａ) | 3:47.36 | 2 | →準決勝 | ||
| 6 |
| № | BNo | Crew | 500m | 1000m | Rank | Qualify |
| 16 5月3日 10:00 予選 ７組 2上り |
1 | 戸島 廉太(岡谷南高校Ｂ) | DNS | |||
| 2 | 大源 崇太(関西高校Ｂ) | 3:53.12 | 4 | |||
| 3 | 池田 憲人(瀬田工業高校) | 3:48.96 | 2 | →準決勝 | ||
| 4 | 大迫 輝英(十津川高校) | 3:52.82 | 3 | |||
| 5 | 萩原 巧也(熊本学園大学付属高校Ｂ) | 3:39.88 | 1 | →準決勝 | ||
| 6 |
| № | BNo | Crew | 500m | 1000m | Rank | Qualify |
| 17 5月3日 10:08 予選 ８組 2上り |
1 | 近藤 祥太(堀川高校Ｂ) | 5:00.10 | 3 | ||
| 2 | 勝田 星良斗(海洋高校Ｂ) | 4:20.92 | 2 | →準決勝 | ||
| 3 | 野田 義友(大津高校) | 3:49.97 | 1 | →準決勝 | ||
| 4 | 木原 洋輔(岡谷南高校Ａ) | DNS | ||||
| 5 | 三上 陽平(桐蔭高校Ｂ) | DNS | ||||
| 6 |
| № | BNo | Crew | 500m | 1000m | Rank | Qualify |
| 18 5月3日 10:16 予選 ９組 2上り |
1 | 尾崎 元輔(今治北高校Ａ) | 3:39.51 | 1 | →準決勝 | |
| 2 | 宮道 汰生(今治南高校) | 3:59.16 | 3 | |||
| 3 | 亀田 陽春(八幡商業高校) | 4:09.54 | 5 | |||
| 4 | 平賀 俊丞(東京選抜Ｂ) | 3:46.63 | 2 | →準決勝 | ||
| 5 | 口石 諒(大村高等学校) | 4:00.98 | 4 | |||
| 6 |
| № | BNo | Crew | 500m | 1000m | Rank | Qualify |
| 67 5月4日 8:48 敗復 １組 3上り |
1 | 齊藤 維月(京都工学院Ｂ) | 4:24.94 | 4 | ||
| 2 | 真木 鈴太朗(今治北高校Ｂ) | 4:08.98 | 3 | →準決勝 | ||
| 3 | 松澤 晃士(松山東高校) | 4:02.91 | 1 | →準決勝 | ||
| 4 | 宮道 汰生(今治南高校) | 4:08.48 | 2 | →準決勝 | ||
| 5 | 原 颯太郎(膳所高校Ｂ) | 4:41.48 | 5 | |||
| 6 |
| № | BNo | Crew | 500m | 1000m | Rank | Qualify |
| 68 5月4日 8:56 敗復 ２組 3上り |
1 | 岸田 慶次郎(高島高校) | 4:42.25 | 4 | ||
| 2 | 野中 翔一郎(京都工学院Ａ) | 4:22.33 | 2 | →準決勝 | ||
| 3 | 大迫 輝英(十津川高校) | 4:16.17 | 1 | →準決勝 | ||
| 4 | 口石 諒(大村高等学校) | 4:24.52 | 3 | →準決勝 | ||
| 5 | 近藤 祥太(堀川高校Ｂ) | 5:46.99 | 5 | |||
| 6 |
| № | BNo | Crew | 500m | 1000m | Rank | Qualify |
| 69 5月4日 9:04 敗復 ３組 3上り |
1 | 亀田 陽春(八幡商業高校) | 4:35.55 | 5 | ||
| 2 | 橋本 航輝(徳島市立高校) | 4:14.20 | 2 | →準決勝 | ||
| 3 | 大源 崇太(関西高校Ｂ) | 4:12.06 | 1 | →準決勝 | ||
| 4 | 河田 兼作(宮津天橋高校Ｂ) | 4:27.58 | 4 | |||
| 5 | 漁 太良(洲本高校) | 4:23.20 | 3 | →準決勝 | ||
| 6 |
| № | BNo | Crew | 500m | 1000m | Rank | Qualify |
| 70 5月4日 9:12 敗復 ４組 3上り |
1 | 塩田 奈由太(彦根東高校) | 4:31.02 | 4 | ||
| 2 | 片山 陸(膳所高校Ａ) | 4:20.28 | 2 | →準決勝 | ||
| 3 | 米久 澪弥(十津川高校) | 4:15.59 | 1 | →準決勝 | ||
| 4 | 田所 凌空(膳所高校Ｃ) | 4:25.56 | 3 | →準決勝 | ||
| 5 | ||||||
| 6 |
| № | BNo | Crew | 500m | 1000m | Rank | Qualify |
| 71 5月4日 9:20 敗復 ５組 3上り |
1 | 永峯 颯大(東京選抜Ａ) | 4:26.13 | 4 | ||
| 2 | 浦 琉介(和歌山北高校) | 4:12.29 | 1 | →準決勝 | ||
| 3 | 村上 巧馬(高島高校) | 4:15.21 | 2 | →準決勝 | ||
| 4 | 重田 幸希人(東舞鶴高校Ｂ) | 4:24.31 | 3 | →準決勝 | ||
| 5 | ||||||
| 6 |
| № | BNo | Crew | 500m | 1000m | Rank | Qualify |
| 121 5月5日 9:10 準決 １組 1上り |
1 | 橋本 航輝(徳島市立高校) | 4:13.34 | 5 | ||
| 2 | 越智 勇登(今治北高校大三島分校) | 4:08.93 | 3 | |||
| 3 | 尾崎 元輔(今治北高校Ａ) | 3:54.29 | 1 | →決勝 | ||
| 4 | 野田 義友(大津高校) | 4:00.54 | 2 | |||
| 5 | 村上 巧馬(高島高校) | 4:10.61 | 4 | |||
| 6 |
| № | BNo | Crew | 500m | 1000m | Rank | Qualify |
| 122 5月5日 9:18 準決 ２組 1上り |
1 | 浦 琉介(和歌山北高校) | 4:09.99 | 4 | ||
| 2 | 池田 憲人(瀬田工業高校) | 4:04.50 | 2 | |||
| 3 | 萩原 巧也(熊本学園大学付属高校Ｂ) | 3:51.68 | 1 | →決勝 | ||
| 4 | 小谷 悠真(桜宮高校) | 4:10.98 | 5 | |||
| 5 | 米久 澪弥(十津川高校) | 4:07.02 | 3 | |||
| 6 |
| № | BNo | Crew | 500m | 1000m | Rank | Qualify |
| 123 5月5日 9:26 準決 ３組 1上り |
1 | 大源 崇太(関西高校Ｂ) | 4:06.98 | 3 | ||
| 2 | 中川 輝大(宇和島東高校) | 4:03.72 | 2 | |||
| 3 | 濵田 琉哉(東舞鶴高校Ａ) | 3:55.73 | 1 | →決勝 | ||
| 4 | 渡辺 将太(岡谷南高校Ｃ) | 4:12.20 | 5 | |||
| 5 | 大迫 輝英(十津川高校) | 4:10.63 | 4 | |||
| 6 |
| № | BNo | Crew | 500m | 1000m | Rank | Qualify |
| 124 5月5日 9:34 準決 ４組 1上り |
1 | 田所 凌空(膳所高校Ｃ) | 4:19.90 | 5 | ||
| 2 | 真木 鈴太朗(今治北高校Ｂ) | 4:18.37 | 4 | |||
| 3 | 福本 心(熊本学園大学付属高校Ａ) | 4:01.29 | 2 | |||
| 4 | 柏野 泰智(関西高校Ａ) | 3:54.65 | 1 | →決勝 | ||
| 5 | 山村 龍之介(愛媛大学附属高校) | 4:25.60 | 6 | |||
| 6 | 片山 陸(膳所高校Ａ) | 4:15.39 | 3 |
| № | BNo | Crew | 500m | 1000m | Rank | Qualify |
| 125 5月5日 9:42 準決 ５組 1上り |
1 | 口石 諒(大村高等学校) | 4:15.31 | 6 | ||
| 2 | 宮道 汰生(今治南高校) | 4:08.13 | 4 | |||
| 3 | 柴田 一景(宮津天橋高校Ａ) | 4:02.33 | 2 | |||
| 4 | 太田 哲惺(堀川高校Ａ) | 3:55.14 | 1 | →決勝 | ||
| 5 | 衛藤 大知(海洋高校Ａ) | 4:07.51 | 3 | |||
| 6 | 野中 翔一郎(京都工学院Ａ) | 4:14.98 | 5 |
| № | BNo | Crew | 500m | 1000m | Rank | Qualify |
| 126 5月5日 9:50 準決 ６組 1上り |
1 | 重田 幸希人(東舞鶴高校Ｂ) | 4:20.49 | 5 | ||
| 2 | 松澤 晃士(松山東高校) | 4:01.71 | 3 | |||
| 3 | 川口 真巧(長崎明誠高校) | 3:51.47 | 2 | |||
| 4 | 平賀 俊丞(東京選抜Ｂ) | 3:50.62 | 1 | →決勝 | ||
| 5 | 勝田 星良斗(海洋高校Ｂ) | 4:20.93 | 6 | |||
| 6 | 漁 太良(洲本高校) | 4:07.08 | 4 |
| № | BNo | Crew | 500m | 1000m | Rank | Qualify |
| 172 5月6日 8:56 決勝 |
1 | 濵田 琉哉(東舞鶴高校Ａ) | 3:41.31 | 4 | ||
| 2 | 柏野 泰智(関西高校Ａ) | 3:47.50 | 6 | |||
| 3 | 萩原 巧也(熊本学園大学付属高校Ｂ) | 3:38.64 | 1 | |||
| 4 | 平賀 俊丞(東京選抜Ｂ) | 3:43.49 | 5 | |||
| 5 | 尾崎 元輔(今治北高校Ａ) | 3:38.72 | 2 | |||
| 6 | 太田 哲惺(堀川高校Ａ) | 3:39.72 | 3 |