| № | BNo | Crew | 500m | 1000m | Rank | Qualify |
| 42 5月3日 13:28 予選 １組 2上り |
1 | 今治南高校 | 4:11.45 | 3 | ||
| 2 | 大村高等学校 | 3:47.13 | 1 | →準決勝 | ||
| 3 | 彦根東高校Ａ | 4:16.53 | 5 | |||
| 4 | 膳所高校Ｃ | DNS | ||||
| 5 | 東京選抜 | 3:52.83 | 2 | →準決勝 | ||
| 6 | 八幡商業高校 | 4:14.01 | 4 |
| № | BNo | Crew | 500m | 1000m | Rank | Qualify |
| 43 5月3日 13:36 予選 ２組 2上り |
1 | 海洋高校Ｂ | 4:20.91 | 6 | ||
| 2 | 堀川高校Ｂ | 4:05.57 | 3 | |||
| 3 | 松山東高校Ａ | 4:05.84 | 4 | |||
| 4 | 洲本高校 | 4:17.48 | 5 | |||
| 5 | 和歌山北高校 | 3:59.37 | 2 | →準決勝 | ||
| 6 | 京都工学院Ａ | 3:57.79 | 1 | →準決勝 |
| № | BNo | Crew | 500m | 1000m | Rank | Qualify |
| 44 5月3日 13:44 予選 ３組 2上り |
1 | 津高校 | 3:52.67 | 3 | ||
| 2 | 長崎明誠高校Ｂ | 5:02.01 | 5 | |||
| 3 | 今治工業高校Ａ | 3:49.26 | 1 | →準決勝 | ||
| 4 | 関西高校Ｂ | 3:52.01 | 2 | →準決勝 | ||
| 5 | 海洋高校Ｃ | DNS | ||||
| 6 | 十津川高校 | 4:59.79 | 4 |
| № | BNo | Crew | 500m | 1000m | Rank | Qualify |
| 45 5月3日 13:52 予選 ４組 2上り |
1 | 徳島市立高校Ｂ | 4:02.29 | 4 | ||
| 2 | 熊本学園大学付属高校Ｃ | 3:52.27 | 1 | →準決勝 | ||
| 3 | 愛媛大学附属高校 | 4:12.46 | 6 | |||
| 4 | 桐蔭高校 | 4:03.68 | 5 | |||
| 5 | 京都工学院Ｂ | 3:54.34 | 3 | |||
| 6 | 相可高校 | 3:52.82 | 2 | →準決勝 |
| № | BNo | Crew | 500m | 1000m | Rank | Qualify |
| 46 5月3日 14:00 予選 ５組 2上り |
1 | 琵琶湖漕艇場ＢＲＣ | 4:11.93 | 6 | ||
| 2 | 熊本学園大学付属高校Ｂ | 3:46.59 | 2 | →準決勝 | ||
| 3 | 東舞鶴高校 | 3:41.64 | 1 | →準決勝 | ||
| 4 | 徳島市立高校Ａ | 4:03.54 | 4 | |||
| 5 | 今治北高校Ｂ | 4:04.09 | 5 | |||
| 6 | 清風高校 | 3:46.82 | 3 |
| № | BNo | Crew | 500m | 1000m | Rank | Qualify |
| 47 5月3日 14:08 予選 ６組 2上り |
1 | 宮津天橋高校Ｃ | DNS | |||
| 2 | 田辺高校 | 4:01.66 | 4 | |||
| 3 | 長崎明誠高校Ａ | 3:58.25 | 3 | |||
| 4 | 朱雀高校Ｂ | 4:08.51 | 5 | |||
| 5 | 岡谷南高校Ｃ | 3:50.15 | 1 | →準決勝 | ||
| 6 | 彦根東高校Ｃ | 3:54.69 | 2 | →準決勝 |
| № | BNo | Crew | 500m | 1000m | Rank | Qualify |
| 48 5月3日 14:16 予選 ７組 2上り |
1 | 宮津天橋高校Ｂ | 4:12.84 | 5 | ||
| 2 | 京都工学院Ｃ | 4:06.24 | 3 | |||
| 3 | 今治工業高校Ｂ | 4:15.77 | 6 | |||
| 4 | 今治北高校Ａ | 3:57.53 | 2 | →準決勝 | ||
| 5 | 海洋高校Ａ | 3:43.47 | 1 | →準決勝 | ||
| 6 | 大津高校 | 4:07.87 | 4 |
| № | BNo | Crew | 500m | 1000m | Rank | Qualify |
| 49 5月3日 14:24 予選 ８組 2上り |
1 | 熊本学園大学付属高校Ａ | 3:30.97 | 1 | →準決勝 | |
| 2 | 彦根東高校Ｂ | 4:15.85 | 5 | |||
| 3 | 早稲田大学高等学院Ｂ | 3:50.95 | 4 | |||
| 4 | 松山東高校Ｂ | 3:39.24 | 2 | →準決勝 | ||
| 5 | 堀川高校Ａ | 4:24.12 | 6 | |||
| 6 | 朱雀高校Ａ | 3:39.48 | 3 |
| № | BNo | Crew | 500m | 1000m | Rank | Qualify |
| 50 5月3日 14:32 予選 ９組 2上り |
1 | 膳所高校Ｂ | 3:57.01 | 3 | ||
| 2 | 京都工学院Ｄ | 4:25.98 | 5 | |||
| 3 | 岡谷南高校Ｂ | 3:59.84 | 4 | |||
| 4 | 瀬田工業高校 | 3:41.20 | 1 | →準決勝 | ||
| 5 | 早稲田大学高等学院Ａ | 3:50.12 | 2 | →準決勝 | ||
| 6 |
| № | BNo | Crew | 500m | 1000m | Rank | Qualify |
| 51 5月3日 14:40 予選 10組 2上り |
1 | 膳所高校Ａ | 4:00.05 | 3 | ||
| 2 | 宮津天橋高校Ａ | 4:21.28 | 5 | |||
| 3 | 岡谷南高校Ａ | 4:01.26 | 4 | |||
| 4 | 桜宮高校 | 3:53.09 | 2 | →準決勝 | ||
| 5 | 関西高校Ａ | 3:46.69 | 1 | →準決勝 | ||
| 6 |
| № | BNo | Crew | 500m | 1000m | Rank | Qualify |
| 96 5月4日 12:40 敗復 １組 2上り |
1 | 彦根東高校Ａ | 4:10.13 | 5 | ||
| 2 | 桐蔭高校 | 3:55.36 | 3 | |||
| 3 | 朱雀高校Ａ | 3:46.54 | 1 | →準決勝 | ||
| 4 | 今治北高校Ｂ | 3:52.86 | 2 | →準決勝 | ||
| 5 | 洲本高校 | 4:04.94 | 4 | |||
| 6 |
| № | BNo | Crew | 500m | 1000m | Rank | Qualify |
| 97 5月4日 12:48 敗復 ２組 2上り |
1 | 彦根東高校Ｂ | 4:19.94 | 5 | ||
| 2 | 徳島市立高校Ａ | 4:08.10 | 4 | |||
| 3 | 清風高校 | 3:46.26 | 1 | →準決勝 | ||
| 4 | 堀川高校Ｂ | 3:53.24 | 2 | →準決勝 | ||
| 5 | 海洋高校Ｂ | 3:56.54 | 3 | |||
| 6 |
| № | BNo | Crew | 500m | 1000m | Rank | Qualify |
| 98 5月4日 12:56 敗復 ３組 2上り |
1 | 今治工業高校Ｂ | 4:03.53 | 5 | ||
| 2 | 徳島市立高校Ｂ | 3:48.62 | 2 | →準決勝 | ||
| 3 | 早稲田大学高等学院Ｂ | 3:51.93 | 3 | |||
| 4 | 松山東高校Ａ | 3:45.73 | 1 | →準決勝 | ||
| 5 | 宮津天橋高校Ａ | 3:59.53 | 4 | |||
| 6 |
| № | BNo | Crew | 500m | 1000m | Rank | Qualify |
| 99 5月4日 13:04 敗復 ４組 2上り |
1 | 八幡商業高校 | 4:10.00 | 3 | ||
| 2 | 田辺高校 | 5:25.78 | 5 | |||
| 3 | 津高校 | 3:45.91 | 1 | →準決勝 | ||
| 4 | 京都工学院Ｃ | 3:55.72 | 2 | →準決勝 | ||
| 5 | 堀川高校Ａ | 4:31.44 | 4 | |||
| 6 |
| № | BNo | Crew | 500m | 1000m | Rank | Qualify |
| 100 5月4日 13:12 敗復 ５組 2上り |
1 | 宮津天橋高校Ｂ | 4:02.78 | 4 | ||
| 2 | 岡谷南高校Ａ | 3:57.53 | 3 | |||
| 3 | 京都工学院Ｂ | 3:48.25 | 1 | →準決勝 | ||
| 4 | 大津高校 | 3:53.17 | 2 | →準決勝 | ||
| 5 | 京都工学院Ｄ | 4:16.30 | 5 | |||
| 6 |
| № | BNo | Crew | 500m | 1000m | Rank | Qualify |
| 101 5月4日 13:20 敗復 ６組 2上り |
1 | 愛媛大学附属高校 | 4:20.16 | 4 | ||
| 2 | 膳所高校Ａ | 3:54.70 | 1 | →準決勝 | ||
| 3 | 膳所高校Ｂ | 3:56.04 | 2 | →準決勝 | ||
| 4 | 朱雀高校Ｂ | 4:05.55 | 3 | |||
| 5 | 十津川高校 | 4:45.61 | 5 | |||
| 6 |
| № | BNo | Crew | 500m | 1000m | Rank | Qualify |
| 102 5月4日 13:28 敗復 ７組 2上り |
1 | 琵琶湖漕艇場ＢＲＣ | 4:10.62 | 2 | →準決勝 | |
| 2 | 岡谷南高校Ｂ | 4:06.32 | 1 | →準決勝 | ||
| 3 | 長崎明誠高校Ａ | DNS | ||||
| 4 | 今治南高校 | 4:26.47 | 3 | |||
| 5 | 長崎明誠高校Ｂ | 4:53.36 | 4 | |||
| 6 |
| № | BNo | Crew | 500m | 1000m | Rank | Qualify |
| 149 5月5日 13:20 準決 １組 1上り |
1 | 朱雀高校Ａ | 3:52.25 | 3 | ||
| 2 | 関西高校Ｂ | 3:51.27 | 2 | |||
| 3 | 熊本学園大学付属高校Ａ | 3:37.74 | 1 | →決勝 | ||
| 4 | 熊本学園大学付属高校Ｃ | 3:53.02 | 4 | |||
| 5 | 京都工学院Ｂ | 3:54.56 | 5 | |||
| 6 |
| № | BNo | Crew | 500m | 1000m | Rank | Qualify |
| 150 5月5日 13:28 準決 ２組 1上り |
1 | 清風高校 | 3:48.09 | 1 | →決勝 | |
| 2 | 岡谷南高校Ｃ | 4:01.47 | 4 | |||
| 3 | 松山東高校Ｂ | 3:54.24 | 3 | |||
| 4 | 相可高校 | 3:52.71 | 2 | |||
| 5 | 徳島市立高校Ｂ | DNS | ||||
| 6 |
| № | BNo | Crew | 500m | 1000m | Rank | Qualify |
| 151 5月5日 13:36 準決 ３組 1上り |
1 | 琵琶湖漕艇場ＢＲＣ | 4:19.42 | 6 | ||
| 2 | 津高校 | 3:57.12 | 2 | |||
| 3 | 早稲田大学高等学院Ａ | 4:02.74 | 4 | |||
| 4 | 瀬田工業高校 | 3:50.09 | 1 | →決勝 | ||
| 5 | 東京選抜 | 3:59.11 | 3 | |||
| 6 | 今治北高校Ｂ | 4:12.51 | 5 |
| № | BNo | Crew | 500m | 1000m | Rank | Qualify |
| 152 5月5日 13:44 準決 ４組 1上り |
1 | 岡谷南高校Ｂ | 4:12.57 | 5 | ||
| 2 | 松山東高校Ａ | 4:02.51 | 3 | |||
| 3 | 今治工業高校Ａ | 4:13.65 | 6 | |||
| 4 | 東舞鶴高校 | 3:45.04 | 1 | →決勝 | ||
| 5 | 桜宮高校 | 3:58.87 | 2 | |||
| 6 | 大津高校 | 4:08.78 | 4 |
| № | BNo | Crew | 500m | 1000m | Rank | Qualify |
| 153 5月5日 13:52 準決 ５組 1上り |
1 | 膳所高校Ｂ | 3:58.99 | 5 | ||
| 2 | 和歌山北高校 | 3:49.78 | 2 | |||
| 3 | 大村高等学校 | 3:52.02 | 3 | |||
| 4 | 海洋高校Ａ | 3:40.72 | 1 | →決勝 | ||
| 5 | 彦根東高校Ｃ | 4:05.88 | 6 | |||
| 6 | 堀川高校Ｂ | 3:57.85 | 4 |
| № | BNo | Crew | 500m | 1000m | Rank | Qualify |
| 154 5月5日 14:00 準決 ６組 1上り |
1 | 京都工学院Ｃ | 4:01.75 | 6 | ||
| 2 | 京都工学院Ａ | 3:47.62 | 4 | |||
| 3 | 関西高校Ａ | 3:38.98 | 1 | →決勝 | ||
| 4 | 熊本学園大学付属高校Ｂ | 3:39.98 | 2 | |||
| 5 | 今治北高校Ａ | 3:41.75 | 3 | |||
| 6 | 膳所高校Ａ | 3:56.75 | 5 |
| № | BNo | Crew | 500m | 1000m | Rank | Qualify |
| 176 5月6日 9:28 決勝 |
1 | 瀬田工業高校 | 3:28.71 | 3 | ||
| 2 | 東舞鶴高校 | 3:28.75 | 4 | |||
| 3 | 関西高校Ａ | 3:34.55 | 5 | |||
| 4 | 熊本学園大学付属高校Ａ | 3:25.77 | 1 | |||
| 5 | 海洋高校Ａ | 3:28.06 | 2 | |||
| 6 | 清風高校 | 3:38.97 | 6 |