| № | BNo | Crew | 500m | 1000m | Rank | Qualify |
| 10 5月3日 9:12 予選 １組 2上り |
1 | 新庄 開(大津高校) | 3:54.46 | 3 | ||
| 2 | 永田 元輝(彦根東高校) | 3:55.41 | 4 | |||
| 3 | 田中 洋輝(愛媛大学附属) | 4:01.09 | 5 | |||
| 4 | 山口 優馬(徳島市立高校) | 3:51.30 | 2 | →準決勝 | ||
| 5 | 北川 裕基(瀬田工業高校) | 3:40.57 | 1 | →準決勝 | ||
| 6 | 吉川 祐司(膳所高校B) | 4:13.05 | 6 |
| № | BNo | Crew | 500m | 1000m | Rank | Qualify |
| 11 5月3日 9:20 予選 ２組 2上り |
1 | 野田 照磨(熊本学園大学付属高校) | 3:49.67 | 2 | →準決勝 | |
| 2 | 山﨑 遙馬(松山東高校B) | 3:52.61 | 4 | |||
| 3 | 三上 元輝(朱雀高校) | 4:23.22 | 6 | |||
| 4 | 坂井 明弘(大村高等学校A) | 4:04.10 | 5 | |||
| 5 | 香田 竜成(長崎明誠高校A) | 3:48.38 | 1 | →準決勝 | ||
| 6 | 齋藤 維月(京都工学院B) | 3:52.08 | 3 |
| № | BNo | Crew | 500m | 1000m | Rank | Qualify |
| 12 5月3日 9:28 予選 ３組 2上り |
1 | 中嶋 舶渡(琵琶湖漕艇場BRC) | 4:02.51 | 4 | ||
| 2 | 小松 睦(東舞鶴高校（棄権）) | DNS | ||||
| 3 | 茅野 喜一(岡谷南高校) | 3:41.14 | 1 | →準決勝 | ||
| 4 | 正 朝輝(松山東高校A) | 3:49.77 | 3 | |||
| 5 | 滝口 靖幸(海洋高校B) | 3:46.82 | 2 | →準決勝 | ||
| 6 | 津田 正太郎(津高校) | 4:13.85 | 5 |
| № | BNo | Crew | 500m | 1000m | Rank | Qualify |
| 13 5月3日 9:36 予選 ４組 2上り |
1 | 飯田 羽瑠(堀川高校A) | 3:53.32 | 1 | →準決勝 | |
| 2 | 長谷川 莉夢(相可高校) | 4:09.16 | 6 | |||
| 3 | 藤山 大輝(宮津天橋高校) | 3:57.80 | 2 | →準決勝 | ||
| 4 | 有請 湧斗(宇和島東高校) | 3:59.85 | 3 | |||
| 5 | 河野 良汰(膳所高校C) | 4:06.08 | 4 | |||
| 6 | 村上 遥大(大村高等学校B) | 4:07.98 | 5 |
| № | BNo | Crew | 500m | 1000m | Rank | Qualify |
| 14 5月3日 9:44 予選 ５組 2上り |
1 | 桑原 健太(堀川高校B) | 4:13.24 | 5 | ||
| 2 | 岸田 慶次郎(高島高校) | 4:00.87 | 4 | |||
| 3 | 杉谷 太規(膳所高校A) | 3:46.30 | 1 | →準決勝 | ||
| 4 | 圓城寺 咲保(熊本学園大学付属高校) | 3:49.83 | 2 | →準決勝 | ||
| 5 | 杉原 清斗(京都工学院A（棄権）) | DNS | ||||
| 6 | 眞鼻 宝功(相生産業高校) | 3:53.34 | 3 |
| № | BNo | Crew | 500m | 1000m | Rank | Qualify |
| 15 5月3日 9:52 予選 ６組 2上り |
1 | 勝田 星良斗(海洋高校A) | 3:48.22 | 2 | →準決勝 | |
| 2 | 西尾 和真(田辺高校) | 4:15.35 | 5 | |||
| 3 | 中川 優人(関西高校) | 3:45.89 | 1 | →準決勝 | ||
| 4 | 北村 太一(瀬田工業高校) | 3:59.40 | 4 | |||
| 5 | 魚井 颯太(洲本高校) | 3:52.31 | 3 | |||
| 6 |
| № | BNo | Crew | 500m | 1000m | Rank | Qualify |
| 63 5月4日 8:48 敗復 １組 1上り |
1 | 長谷川 莉夢(相可高校) | 4:10.19 | 4 | ||
| 2 | 北村 太一(瀬田工業高校) | 4:04.49 | 3 | |||
| 3 | 正 朝輝(松山東高校A) | 3:45.81 | 1 | →準決勝 | ||
| 4 | 有請 湧斗(宇和島東高校) | 3:57.53 | 2 | |||
| 5 | 吉川 祐司(膳所高校B) | 4:10.66 | 5 | |||
| 6 |
| № | BNo | Crew | 500m | 1000m | Rank | Qualify |
| 64 5月4日 8:56 敗復 ２組 1上り |
1 | 村上 遥大(大村高等学校B) | 4:04.85 | 4 | ||
| 2 | 永田 元輝(彦根東高校) | 3:53.51 | 2 | |||
| 3 | 齋藤 維月(京都工学院B) | 3:50.99 | 1 | →準決勝 | ||
| 4 | 岸田 慶次郎(高島高校) | 4:03.60 | 3 | |||
| 5 | 桑原 健太(堀川高校B) | 4:10.17 | 5 | |||
| 6 |
| № | BNo | Crew | 500m | 1000m | Rank | Qualify |
| 65 5月4日 9:04 敗復 ３組 1上り |
1 | 河野 良汰(膳所高校C) | 4:07.71 | 5 | ||
| 2 | 新庄 開(大津高校) | 3:56.50 | 2 | |||
| 3 | 魚井 颯太(洲本高校) | 3:52.53 | 1 | →準決勝 | ||
| 4 | 田中 洋輝(愛媛大学附属) | 4:00.68 | 4 | |||
| 5 | 津田 正太郎(津高校) | 3:59.04 | 3 | |||
| 6 |
| № | BNo | Crew | 500m | 1000m | Rank | Qualify |
| 66 5月4日 9:12 敗復 ４組 1上り |
1 | 三上 元輝(朱雀高校) | 4:19.46 | 6 | ||
| 2 | 坂井 明弘(大村高等学校A) | 3:58.02 | 3 | |||
| 3 | 眞鼻 宝功(相生産業高校) | 3:49.80 | 1 | →準決勝 | ||
| 4 | 山﨑 遙馬(松山東高校B) | 3:50.48 | 2 | |||
| 5 | 中嶋 舶渡(琵琶湖漕艇場BRC) | 4:01.45 | 4 | |||
| 6 | 西尾 和真(田辺高校) | 4:13.17 | 5 |
| № | BNo | Crew | 500m | 1000m | Rank | Qualify |
| 112 5月5日 8:50 準決 １組 2上り |
1 | 藤山 大輝(宮津天橋高校) | 3:58.17 | 5 | ||
| 2 | 勝田 星良斗(海洋高校A) | 3:51.14 | 4 | |||
| 3 | 北川 裕基(瀬田工業高校) | 3:36.17 | 1 | →決勝 | ||
| 4 | 香田 竜成(長崎明誠高校A) | 3:45.76 | 3 | |||
| 5 | 正 朝輝(松山東高校A) | 3:45.21 | 2 | →決勝 | ||
| 6 |
| № | BNo | Crew | 500m | 1000m | Rank | Qualify |
| 113 5月5日 8:58 準決 ２組 2上り |
1 | 飯田 羽瑠(堀川高校A) | 3:49.72 | 3 | ||
| 2 | 滝口 靖幸(海洋高校B) | 3:46.44 | 2 | →決勝 | ||
| 3 | 茅野 喜一(岡谷南高校) | 3:44.36 | 1 | →決勝 | ||
| 4 | 野田 照磨(熊本学園大学付属高校) | 3:58.36 | 5 | |||
| 5 | 眞鼻 宝功(相生産業高校) | 3:52.07 | 4 | |||
| 6 |
| № | BNo | Crew | 500m | 1000m | Rank | Qualify |
| 114 5月5日 9:06 準決 ３組 2上り |
1 | 魚井 颯太(洲本高校) | 4:00.01 | 6 | ||
| 2 | 山口 優馬(徳島市立高校) | 3:53.61 | 4 | |||
| 3 | 杉谷 太規(膳所高校A) | 3:43.90 | 2 | →決勝 | ||
| 4 | 中川 優人(関西高校) | 3:41.73 | 1 | →決勝 | ||
| 5 | 圓城寺 咲保(熊本学園大学付属高校) | 3:45.03 | 3 | |||
| 6 | 齋藤 維月(京都工学院B) | 3:55.66 | 5 |
| № | BNo | Crew | 500m | 1000m | Rank | Qualify |
| 157 5月6日 8:56 決勝 |
1 | 滝口 靖幸(海洋高校B) | 3:52.35 | 6 | ||
| 2 | 茅野 喜一(岡谷南高校) | 3:44.83 | 3 | |||
| 3 | 中川 優人(関西高校) | 3:42.83 | 2 | |||
| 4 | 北川 裕基(瀬田工業高校) | 3:38.31 | 1 | |||
| 5 | 杉谷 太規(膳所高校A) | 3:47.92 | 4 | |||
| 6 | 正 朝輝(松山東高校A) | 3:49.42 | 5 |