| № | BNo | Crew | 500m | 1000m | Rank | Qualify |
| 39 5月3日 13:04 予選 １組 2上り |
1 | 今治北高校B | 3:33.29 | 4 | ||
| 2 | 岡谷南高校B | 3:32.32 | 3 | |||
| 3 | 京都工学院D | 4:05.91 | 6 | |||
| 4 | 琵琶湖漕艇場BRC | 3:36.99 | 5 | |||
| 5 | 今治工業高校C | 3:30.09 | 2 | →準決勝 | ||
| 6 | 東京選抜A | 3:24.91 | 1 | →準決勝 |
| № | BNo | Crew | 500m | 1000m | Rank | Qualify |
| 40 5月3日 13:12 予選 ２組 2上り |
1 | 東京選抜C | 3:31.14 | 3 | ||
| 2 | 松山東高校A | 3:26.03 | 1 | →準決勝 | ||
| 3 | 大村高等学校B | 3:43.60 | 6 | |||
| 4 | 高島高校 | 3:40.45 | 4 | |||
| 5 | 膳所高校B | 3:42.10 | 5 | |||
| 6 | 相可高校A | 3:29.72 | 2 | →準決勝 |
| № | BNo | Crew | 500m | 1000m | Rank | Qualify |
| 41 5月3日 13:20 予選 ３組 2上り |
1 | 関西高校A | 3:23.12 | 2 | →準決勝 | |
| 2 | 松山東高校B | 3:25.70 | 3 | |||
| 3 | 今治南高校A | 3:26.82 | 4 | |||
| 4 | 京都工学院B | 3:27.86 | 5 | |||
| 5 | 大村高等学校A | 3:21.73 | 1 | →準決勝 | ||
| 6 | 朱雀高校B | 4:01.38 | 6 |
| № | BNo | Crew | 500m | 1000m | Rank | Qualify |
| 42 5月3日 13:28 予選 ４組 2上り |
1 | 海洋高校A | 3:28.72 | 3 | ||
| 2 | 今治工業高校A | 3:34.39 | 4 | |||
| 3 | 関西高校B | 3:25.39 | 1 | →準決勝 | ||
| 4 | 大村高等学校C | 3:37.25 | 5 | |||
| 5 | 大津高校 | 3:42.71 | 6 | |||
| 6 | 京都工学院A | 3:28.06 | 2 | →準決勝 |
| № | BNo | Crew | 500m | 1000m | Rank | Qualify |
| 43 5月3日 13:36 予選 ５組 2上り |
1 | 和歌山北高校A | 3:29.09 | 2 | →準決勝 | |
| 2 | 長崎明誠高校B | 3:39.85 | 5 | |||
| 3 | 松山東高校C | 3:35.98 | 4 | |||
| 4 | 彦根東高校 | 3:40.90 | 6 | |||
| 5 | 今治工業高校D | 3:25.83 | 1 | →準決勝 | ||
| 6 | 京都工学院C | 3:29.78 | 3 |
| № | BNo | Crew | 500m | 1000m | Rank | Qualify |
| 44 5月3日 13:44 予選 ６組 2上り |
1 | 岡谷南高校A | 3:28.10 | 4 | ||
| 2 | 和歌山北高校B | 3:26.07 | 3 | |||
| 3 | 今治南高校B | 3:58.83 | 6 | |||
| 4 | 相可高校B | 3:50.71 | 5 | |||
| 5 | 瀬田工業高校 | 3:22.43 | 1 | →準決勝 | ||
| 6 | 宮津天橋高校A | 3:25.20 | 2 | →準決勝 |
| № | BNo | Crew | 500m | 1000m | Rank | Qualify |
| 45 5月3日 13:52 予選 ７組 2上り |
1 | 膳所高校A | 3:30.52 | 3 | ||
| 2 | 津高校 | 3:33.87 | 6 | |||
| 3 | 徳島市立高校A | 3:33.12 | 5 | |||
| 4 | 熊本学園大学付属高校 | 3:32.48 | 4 | |||
| 5 | 桐蔭高校 | 3:29.20 | 2 | →準決勝 | ||
| 6 | 東京選抜B | 3:27.31 | 1 | →準決勝 |
| № | BNo | Crew | 500m | 1000m | Rank | Qualify |
| 46 5月3日 14:00 予選 ８組 2上り |
1 | 朱雀高校A | 3:25.18 | 2 | →準決勝 | |
| 2 | 今治北高校A | 3:24.29 | 1 | →準決勝 | ||
| 3 | 長崎明誠高校A | 3:39.79 | 4 | |||
| 4 | 海洋高校B | 3:48.42 | 5 | |||
| 5 | 清風高校 | 3:29.39 | 3 | |||
| 6 |
| № | BNo | Crew | 500m | 1000m | Rank | Qualify |
| 47 5月3日 14:08 予選 ９組 2上り |
1 | 今治工業高校B | 3:28.85 | 1 | →準決勝 | |
| 2 | 今治北高校C | 3:44.91 | 3 | |||
| 3 | 徳島市立高校B | 3:45.80 | 4 | |||
| 4 | 洲本高校 | 3:36.88 | 2 | →準決勝 | ||
| 5 | 宮津天橋高校B | 4:04.89 | 5 | |||
| 6 |
| № | BNo | Crew | 500m | 1000m | Rank | Qualify |
| 91 5月4日 12:32 敗復 １組 3上り |
1 | 膳所高校B | 3:39.10 | 4 | ||
| 2 | 熊本学園大学付属高校 | 3:32.56 | 2 | →準決勝 | ||
| 3 | 松山東高校B | 3:26.41 | 1 | →準決勝 | ||
| 4 | 徳島市立高校A | 3:34.81 | 3 | →準決勝 | ||
| 5 | 大津高校 | 3:43.34 | 5 | |||
| 6 |
| № | BNo | Crew | 500m | 1000m | Rank | Qualify |
| 92 5月4日 12:40 敗復 ２組 3上り |
1 | 彦根東高校 | 3:48.49 | 5 | ||
| 2 | 岡谷南高校B | 3:30.08 | 2 | →準決勝 | ||
| 3 | 和歌山北高校B | 3:28.12 | 1 | →準決勝 | ||
| 4 | 今治北高校B | 3:32.39 | 3 | →準決勝 | ||
| 5 | 大村高等学校B | 3:43.29 | 4 | |||
| 6 |
| № | BNo | Crew | 500m | 1000m | Rank | Qualify |
| 93 5月4日 12:48 敗復 ３組 3上り |
1 | 京都工学院D | 4:00.49 | 6 | ||
| 2 | 高島高校 | 3:41.30 | 5 | |||
| 3 | 東京選抜C | 3:30.86 | 2 | →準決勝 | ||
| 4 | 今治南高校A | 3:28.59 | 1 | →準決勝 | ||
| 5 | 津高校 | 3:33.03 | 3 | →準決勝 | ||
| 6 | 今治北高校C | 3:36.81 | 4 |
| № | BNo | Crew | 500m | 1000m | Rank | Qualify |
| 94 5月4日 12:56 敗復 ４組 3上り |
1 | 宮津天橋高校B | 4:04.69 | 6 | ||
| 2 | 長崎明誠高校B | 3:39.91 | 4 | |||
| 3 | 膳所高校A | 3:30.46 | 3 | →準決勝 | ||
| 4 | 京都工学院B | 3:29.06 | 1 | →準決勝 | ||
| 5 | 今治工業高校A | 3:30.01 | 2 | →準決勝 | ||
| 6 | 徳島市立高校B | 3:43.34 | 5 |
| № | BNo | Crew | 500m | 1000m | Rank | Qualify |
| 95 5月4日 13:04 敗復 ５組 3上り |
1 | 朱雀高校B | 3:44.70 | 6 | ||
| 2 | 長崎明誠高校A | 3:34.67 | 4 | |||
| 3 | 京都工学院C | 3:33.34 | 2 | →準決勝 | ||
| 4 | 岡谷南高校A | 3:23.11 | 1 | →準決勝 | ||
| 5 | 松山東高校C | 3:33.62 | 3 | →準決勝 | ||
| 6 | 海洋高校B | 3:42.24 | 5 |
| № | BNo | Crew | 500m | 1000m | Rank | Qualify |
| 96 5月4日 13:12 敗復 ６組 3上り |
1 | 今治南高校B | 3:59.10 | 6 | ||
| 2 | 大村高等学校C | 3:37.62 | 4 | |||
| 3 | 清風高校 | 3:32.02 | 2 | →準決勝 | ||
| 4 | 海洋高校A | 3:25.63 | 1 | →準決勝 | ||
| 5 | 琵琶湖漕艇場BRC | 3:35.30 | 3 | →準決勝 | ||
| 6 | 相可高校B | 3:45.13 | 5 |
| № | BNo | Crew | 500m | 1000m | Rank | Qualify |
| 131 5月5日 11:32 準決 １組 1上り |
1 | 琵琶湖漕艇場BRC | 3:34.38 | 6 | ||
| 2 | 京都工学院B | 3:25.85 | 2 | |||
| 3 | 京都工学院A | 3:28.15 | 4 | |||
| 4 | 大村高等学校A | 3:20.35 | 1 | →決勝 | ||
| 5 | 今治工業高校B | 3:26.48 | 3 | |||
| 6 | 今治工業高校A | 3:30.01 | 5 |
| № | BNo | Crew | 500m | 1000m | Rank | Qualify |
| 132 5月5日 11:40 準決 ２組 1上り |
1 | 徳島市立高校A | 3:34.15 | 6 | ||
| 2 | 今治南高校A | 3:28.80 | 4 | |||
| 3 | 東京選抜B | 3:23.35 | 2 | |||
| 4 | 瀬田工業高校 | 3:21.68 | 1 | →決勝 | ||
| 5 | 和歌山北高校A | 3:27.21 | 3 | |||
| 6 | 岡谷南高校B | 3:33.35 | 5 |
| № | BNo | Crew | 500m | 1000m | Rank | Qualify |
| 133 5月5日 11:48 準決 ３組 1上り |
1 | 松山東高校C | 3:35.39 | 6 | ||
| 2 | 和歌山北高校B | 3:25.18 | 3 | |||
| 3 | 松山東高校A | 3:20.37 | 1 | →決勝 | ||
| 4 | 関西高校A | 3:20.78 | 2 | |||
| 5 | 桐蔭高校 | 3:29.89 | 4 | |||
| 6 | 膳所高校A | 3:31.18 | 5 |
| № | BNo | Crew | 500m | 1000m | Rank | Qualify |
| 134 5月5日 11:56 準決 ４組 1上り |
1 | 京都工学院C | 3:32.32 | 4 | ||
| 2 | 松山東高校B | 3:27.88 | 2 | |||
| 3 | 今治工業高校D | 3:31.97 | 3 | |||
| 4 | 今治北高校A | 3:24.22 | 1 | →決勝 | ||
| 5 | 相可高校A | 3:39.39 | 6 | |||
| 6 | 東京選抜C | 3:32.57 | 5 |
| № | BNo | Crew | 500m | 1000m | Rank | Qualify |
| 135 5月5日 12:04 準決 ５組 1上り |
1 | 津高校 | 3:34.43 | 5 | ||
| 2 | 海洋高校A | 3:29.29 | 2 | |||
| 3 | 関西高校B | 3:26.43 | 1 | →決勝 | ||
| 4 | 東京選抜A | 3:38.37 | 6 | |||
| 5 | 今治工業高校C | 3:32.01 | 3 | |||
| 6 | 清風高校 | 3:33.61 | 4 |
| № | BNo | Crew | 500m | 1000m | Rank | Qualify |
| 136 5月5日 12:12 準決 ６組 1上り |
1 | 熊本学園大学付属高校 | 3:36.09 | 5 | ||
| 2 | 岡谷南高校A | 3:24.11 | 1 | →決勝 | ||
| 3 | 宮津天橋高校A | 3:28.23 | 3 | |||
| 4 | 朱雀高校A | 3:25.01 | 2 | |||
| 5 | 洲本高校 | 3:35.07 | 4 | |||
| 6 | 今治北高校B | 3:36.68 | 6 |
| № | BNo | Crew | 500m | 1000m | Rank | Qualify |
| 161 5月6日 9:28 決勝 |
1 | 関西高校B | 3:31.98 | 6 | ||
| 2 | 岡谷南高校A | 3:29.60 | 5 | |||
| 3 | 松山東高校A | 3:28.87 | 4 | |||
| 4 | 大村高等学校A | 3:21.93 | 1 | |||
| 5 | 瀬田工業高校 | 3:26.45 | 3 | |||
| 6 | 今治北高校A | 3:25.52 | 2 |