| № | BNo | Crew | 500m | 1000m | Rank | Qualify |
| 26 5月3日 11:20 予選 １組 2上り |
1 | 熊本学園大学付属高校 | 3:35.72 | 1 | →準決勝 | |
| 2 | 今治南高校 | 3:52.43 | 4 | |||
| 3 | 大津高校 | 3:44.98 | 3 | |||
| 4 | 今治西高校 | 3:36.36 | 2 | →準決勝 | ||
| 5 | 津高校Ｂ | 4:03.35 | 5 | |||
| 6 |
| № | BNo | Crew | 500m | 1000m | Rank | Qualify |
| 27 5月3日 11:28 予選 ２組 2上り |
1 | 松山東高校 | 3:43.05 | 1 | →準決勝 | |
| 2 | 堀川高校 | 3:45.87 | 3 | |||
| 3 | 洲本高校 | 3:46.76 | 4 | |||
| 4 | 大村高校 | 3:43.28 | 2 | →準決勝 | ||
| 5 | 膳所高校Ｂ | 4:01.53 | 5 | |||
| 6 |
| № | BNo | Crew | 500m | 1000m | Rank | Qualify |
| 28 5月3日 11:36 予選 ３組 2上り |
1 | 宮津天橋高校 | 4:00.21 | 4 | ||
| 2 | 今治北高校Ａ | 3:37.11 | 1 | →準決勝 | ||
| 3 | 津高校Ａ | 3:47.57 | 3 | |||
| 4 | 膳所高校Ａ | 3:42.36 | 2 | →準決勝 | ||
| 5 | ||||||
| 6 |
| № | BNo | Crew | 500m | 1000m | Rank | Qualify |
| 51 5月3日 14:40 敗復 １組 3上り |
1 | 津高校Ｂ | 4:09.93 | 4 | ||
| 2 | 津高校Ａ | 3:52.38 | 2 | →準決勝 | ||
| 3 | 大津高校 | 3:48.78 | 1 | →準決勝 | ||
| 4 | 今治南高校 | 3:59.07 | 3 | →準決勝 | ||
| 5 | ||||||
| 6 |
| № | BNo | Crew | 500m | 1000m | Rank | Qualify |
| 52 5月3日 14:48 敗復 ２組 3上り |
1 | 膳所高校Ｂ | 4:04.39 | 3 | →準決勝 | |
| 2 | 洲本高校 | 3:54.14 | 1 | →準決勝 | ||
| 3 | 堀川高校 | 3:56.05 | 2 | →準決勝 | ||
| 4 | 宮津天橋高校 | 4:06.93 | 4 | |||
| 5 | ||||||
| 6 |