| № | BNo | Crew | 500m | 1000m | Rank | Qualify |
| 64 5月5日 8:56 予選 １組 3上り |
1 | 同志社大学Ａ | 3:15.39 | 1 | →準決勝 | |
| 2 | 立命館大学 | 3:17.05 | 2 | →準決勝 | ||
| 3 | 龍谷大学 | 3:24.62 | 3 | →準決勝 | ||
| 4 | 滋賀医科大学 | 3:56.98 | 4 | |||
| 5 | 京都大学医学部Ａ | DNS | ||||
| 6 |
| № | BNo | Crew | 500m | 1000m | Rank | Qualify |
| 65 5月5日 9:04 予選 ２組 3上り |
1 | 滋賀大学Ａ | 3:37.65 | 3 | →準決勝 | |
| 2 | 岡山大学 | 4:07.18 | 5 | |||
| 3 | 滋賀大学教育学部 青波 | 3:38.21 | 4 | |||
| 4 | 愛媛大学Ａ | 3:32.03 | 1 | →準決勝 | ||
| 5 | 関西学院大学Ａ | 3:34.38 | 2 | →準決勝 | ||
| 6 |
| № | BNo | Crew | 500m | 1000m | Rank | Qualify |
| 66 5月5日 9:12 予選 ３組 3上り |
1 | 関西学院大学Ｂ | 3:54.50 | 5 | ||
| 2 | 京都大学医学部Ｂ | 3:30.96 | 3 | →準決勝 | ||
| 3 | 広島大学Ｂ | 3:47.23 | 4 | |||
| 4 | 同志社大学Ｂ | 3:21.63 | 2 | →準決勝 | ||
| 5 | 松山大学Ａ | 3:20.57 | 1 | →準決勝 | ||
| 6 |
| № | BNo | Crew | 500m | 1000m | Rank | Qualify |
| 67 5月5日 9:20 予選 ４組 3上り |
1 | 今治造船 | 3:16.94 | 1 | →準決勝 | |
| 2 | 同志社大学Ｃ | 3:47.71 | 5 | |||
| 3 | 愛媛大学Ｂ | 3:30.55 | 3 | →準決勝 | ||
| 4 | 京都大学 | 3:44.10 | 4 | |||
| 5 | 京都大学医学部Ｃ | 3:27.41 | 2 | →準決勝 | ||
| 6 |
| № | BNo | Crew | 500m | 1000m | Rank | Qualify |
| 68 5月5日 9:28 予選 ５組 3上り |
1 | 松山大学Ｂ | 3:33.13 | 1 | →準決勝 | |
| 2 | 京都大学医学部Ｄ | 3:33.72 | 2 | →準決勝 | ||
| 3 | 広島大学Ａ | 3:47.99 | 4 | |||
| 4 | 岡山大学医・歯学部 涼風 | 3:34.46 | 3 | →準決勝 | ||
| 5 | 滋賀大学Ｂ | 4:00.71 | 5 | |||
| 6 |
| № | BNo | Crew | 500m | 1000m | Rank | Qualify |
| 99 5月5日 13:36 敗者戦 １組 |
1 | 関西学院大学Ｂ | 4:00.31 | 6 | ||
| 2 | 同志社大学Ｃ | 3:57.58 | 5 | |||
| 3 | 京都大学 | 3:49.16 | 3 | |||
| 4 | 滋賀大学教育学部 青波 | 3:50.77 | 4 | |||
| 5 | 広島大学Ｂ | 3:43.72 | 1 | |||
| 6 | 広島大学Ａ | 3:48.20 | 2 |
| № | BNo | Crew | 500m | 1000m | Rank | Qualify |
| 100 5月5日 13:44 敗者戦 ２組 |
1 | 滋賀大学Ｂ | 4:03.96 | 1 | ||
| 2 | 滋賀医科大学 | 4:06.72 | 2 | |||
| 3 | 岡山大学 | 4:15.90 | 3 | |||
| 4 | ||||||
| 5 | ||||||
| 6 |
| № | BNo | Crew | 500m | 1000m | Rank | Qualify |
| 101 5月5日 13:52 準決 １組 2上り |
1 | 京都大学医学部Ｄ | 3:44.20 | 5 | ||
| 2 | 龍谷大学 | 3:25.72 | 2 | →決勝 | ||
| 3 | 同志社大学Ａ | 3:22.07 | 1 | →決勝 | ||
| 4 | 京都大学医学部Ｃ | 3:35.72 | 3 | |||
| 5 | 関西学院大学Ａ | 3:40.01 | 4 | |||
| 6 |
| № | BNo | Crew | 500m | 1000m | Rank | Qualify |
| 102 5月5日 14:00 準決 ２組 2上り |
1 | 松山大学Ｂ | 3:35.99 | 4 | ||
| 2 | 同志社大学Ｂ | 3:28.31 | 2 | →決勝 | ||
| 3 | 今治造船 | 3:20.19 | 1 | →決勝 | ||
| 4 | 愛媛大学Ｂ | 3:35.05 | 3 | |||
| 5 | 岡山大学医・歯学部 涼風 | 3:52.77 | 5 | |||
| 6 |
| № | BNo | Crew | 500m | 1000m | Rank | Qualify |
| 103 5月5日 14:08 準決 ３組 2上り |
1 | 愛媛大学Ａ | 3:35.67 | 3 | ||
| 2 | 松山大学Ａ | 3:24.37 | 2 | →決勝 | ||
| 3 | 立命館大学 | 3:24.13 | 1 | →決勝 | ||
| 4 | 京都大学医学部Ｂ | 3:39.70 | 4 | |||
| 5 | 滋賀大学Ａ | 3:52.19 | 5 | |||
| 6 |
| № | BNo | Crew | 500m | 1000m | Rank | Qualify |
| 122 5月6日 10:00 決勝 |
1 | 同志社大学Ｂ | 3:21.21 | 4 | ||
| 2 | 松山大学Ａ | 3:24.46 | 6 | |||
| 3 | 同志社大学Ａ | 3:15.90 | 2 | |||
| 4 | 今治造船 | 3:13.97 | 1 | |||
| 5 | 立命館大学 | 3:20.56 | 3 | |||
| 6 | 龍谷大学 | 3:23.25 | 5 |